服务项目介绍
1 分子量检测:分子量是蛋白、多肽、化合物重要的表征信息。对蛋白、多肽、化合物的分子量检测,可以提供目标蛋白、多肽、化合物分离纯化的重要指导信息。
2 蛋白质鉴定:电泳或者液相色谱分离纯化的蛋白样品经过特异性的蛋白内切酶酶切, 可以形成分子量特定的肽段。通过Mascot 软件将实验检测到的酶解肽段分子量信息与数据库中的蛋白酶切理论肽段分子量信息进行比对, 即可实现对目标蛋白的鉴定(PMF 分析)。在此基础上,亦可选择信噪比高的酶解肽段通过激光诱导解离和碰撞诱导解离方式进一步片段化并进行质谱检测和二级质谱信息数据库比对,实现更加精确可靠的蛋白鉴定。
3 De novo sequencing 质谱测序:很多情况下,由于肽段发生未知翻译后修饰、理论数据库氨基酸序列信息错误、氨基酸序列多态性、目标蛋白氨基酸序列信息缺失等原因, 依赖于搜库软件进行实验数据和理论数据库的比对并不能成功实现蛋白/多肽鉴定。De novo sequencing 质谱测序可以不依赖于与理论数据库的比对,实现对目标肽段序列的解析:通过PSD 二级质谱采集到的 MS/MS 谱图富含目标段骨架化学键断裂产生的丰富的碎片离子信息。通过对谱图中b离子、y 离子、a 离子、i离子等碎片离子的人工解析,可以获得目标段的氨基酸序列信息。
4 末端测序:依赖于 MALDI 质谱的ISD 技术, 可使完整蛋白或肽段在离子源内发生断裂, 获得蛋白或肽段断裂形成的c离子和 /或z离子,通过连续断裂的c 离子和 /或 z离子的 m/z, 可获得靠近蛋白/肽段 N 端和/或C 端的基酸序列信息,选定特定的c离子或z离子进行 TOF/TOF 串联质谱分析(T3)测序,即可获得蛋白/肽段最N端或最C端的氨基酸序列信息。
5 二硫键定位:二硫键对于稳定蛋白质3D 结构具有重要意义。二硫键定位分析可为蛋白质结构与功能的研究提供重要信息。通过二硫键链接的两段肽A和 B 与链间交联的产物肽段C满足 m/z(peak A)+ m/z(peak B)- m/z(H2+H))=m/z(peak C),可筛选出二硫键链接的肽段用于二级质谱分析并最终实现二硫键定位。
设备信息
仪器名称 |
品牌型号 |
放置地点 |
联系人 |
联系方式 |
MALDI-TOF/TOF质谱仪 |
Bruker Auto speed |
云南省昆明市教场东路32号中国科学院昆明动物研究所教场园区主楼111室 |
曾琳 |
0871-65191088 |
该仪器采用基质辅助激光解析电离产生离子源。通过基质吸收激光释放的能量使共结晶的样品林子化。采用飞行时间检测器检测带点离子的飞行时间,由于飞行时间和带电离子的质荷比正相关,可以通过飞行时间的检测获得带电离子的分子量信息。