倒置荧光显微镜是近代发展起来的新式荧光显微镜，特点是激发光从物镜向下落射到标本表面，即用同一物镜作为照明聚光器和收集荧光的物镜，可满足不同荧光反应产物的需要。此种荧光显微镜的优点是视野照明均匀，成像清晰，放大倍数愈大荧光愈强。

具有在培养瓶、培养皿内或载玻片上进行显微观察的特点。可以观察组织培养中活细胞形态结构、不染色的组织切片或缺少反差的染色标本；观察无色透明活体标本的细微结构；观察标本中的自发荧光物质或以荧光素染色、标记的细胞和结构等。特别适用于对活体细胞和组织、流质、沉淀物等进行显微研究，是生物学、细胞学、肿瘤学、遗传学、免疫学等研究工作的理想仪器。