生命条形码南方中心:是应我国加入国际生命条形码计划 (iBOL)的需求,于2011年1月成立,是国内首家面向DNA条形码研究和利用的综合性平台,专门从事DNA条形码相关的科学研究、技术革新和应用推广的创新单元,同时也是中国西南野生生物种质资源库动物分库无脊椎动物遗传资源库和云南濒科委司法鉴定中心分子生物学部的挂靠部门。该中心成立的主要目的就是:推动我国一系列重大DNA条形码计划的实施;采集和收集野生无脊椎动物资源丰富本室遗传资源;探索分子生物学技术在经济社会中的应用等。
中心目前的主要任务包括:对各类野生生物的标本采集、保存和规模化管理,样品DNA的提取,条形码标准基因的设计和筛选,目标片段克隆,高通量测序,数据库、信息平台和实验室信息管理系统LIMS的研发和维护,以及基于DNA条形码技术应用探索等方面发挥重要作用。生命条形码南方中心是国际生命条形码——中国项目的重要组成部分,通过以上工作的开展,为本实验室提供科研数据和标本,以及生物多样性研究方面提供支撑服务。
团队:
生命条形码南方中心现有专职工作人员6名,包括中心负责人一名,研究实习员两名,实验师一名,助理实验师两名。所有工作人员都有相关的分子遗传学背景,并经过分子实验的培训,熟悉相关的分子实验。所有工作人员根据自己的工作内容撰写了本中心DNA条形码生产的标准工作流程(SOP),并对相关的参与DNA条形码研究的团队进行DNA条形码实验培训。
中心的发展情况:
1.高通量DNA条形码工作平台的建立
本中心成立的首要任务就是建立一个高通量,高效率的DNA条形码的实验平台。从部门成立起,本中心通过技术创新,建立了生命条形码南方中心标准作业流程 (SOP),并搭建了百万级别的二维条形码样品存储和管理平台、可同时进行15通量的PCR扩增阵列、超景深三维显微系统。此外,对DNA提取和PCR产物凑板操作实现了自动化,并使PCR检测的成本大幅度降低。目前已基本建立起一个高通量DNA条形码工作平台。 2.基于测序技术的混合线粒体基因组测序方法
基于新推出的Ion Torrent测序技术,本中心开发了一套利用长PCR扩增片段混合测序的线粒体基因组测序方法。该方法已经在两栖纲、哺乳纲、蛛形纲和爬行纲41个物种获得了较好的扩增结果,并利用一张314芯片获得两栖纲7个物种的线粒体全基因组序列。
3.肉制品溯源技术——DNA条形码方法
食品安全是国家安全战略的一部分,事关全人类的健康福祉,其中食品检测是保障食品安全的技术基础。我们针对传统食品检测技术无法对肉制品来源和真伪进行检测的缺点,以DNA条码技术为核心,实现了鱼肉和主要畜禽肉类来源快速检测的关键技术,在工商、食品监督管理等领域取得一批示范性应用成果,获得社会的广泛赞誉。
4.支持的重大DNA条形码研究项目
该平台主要服务于若干重大DNA条形码研究项目,包括:野生动物种质资源库的建设(中国科学院大科学装置)、DNA条形码与类群分子系统进化研究(中国科学院知识创新工程重要方向)、DNA条形码标准基因的进化和隐存生物多样性研究(国家自然科学基金重大项目),基于自然保护区的DNA条形码(科技基础性专项),重要生物DNA条形码的技术规范体系与信息系统构建(科技基础性专项),国际两栖爬行类DNA条形码计划Cold Code等。