2015年8月14日上午,应“遗传资源与进化国家重点实验室”计算生物与医学生态学学科组马占山研究员的邀请,天津大学大学邹权教授为我所师生作了题为UltraLarge Phylogenetic Tree Reconstruction with Google Hadoop Parallel Technology和 Recent Advanced in the Computational Biology of microRNA的学术报告。
Hadoop 原本来自于谷歌的一款名为 MapReduce 的编程模型包。Hadoop可以把一个应用程序分解为许多并行计算指令,跨大量的计算节点运行非常巨大的数据集,而且对计算机性能的要求并不是很高。邹教授将 Hadoop 应用于大型进化树的构建中,并且与目前已有的许多进化树构建软件进行了比较,邹教授的成果所能运算的数据集更大,运算时间更短。
microRNA 研究方面,邹权教授首先阐述了 microRNA 的研究背景,对先前的 microRNA识别方法假阳性太高的原因进行了分析。针对先前研究的不足进行改进,重新选择可靠的训练样本采用新的反例集挖掘方法和机器学习方法来识别 microRNA,得到了更加准确的预测结果。紧接着邹教授对 isomiR 的概念、重要性、研究现状以及邹教授目前的研究工作和进展进行了简单的阐述。最后邹教授与参与报告的同学就 microRNA 的研究进行了热烈的讨论。
邹权教授是天津大学计算机学院特聘研究员,目前已在Bioinformatics ,Briefings in Bioinformatics, IEEE 等生物信息和计算机领域的权威杂志发表30余篇高质量研究论文。目前主持多项国家自然科学基金项目。邹教授于2009年博士期间论文获选中国数据挖掘会议(CCDM)大会优秀学生论文,更于2014年荣获CCDM数据挖掘竞赛第一名。