2015年10月17日下午,应遗传资源与进化国家重点实验室计算生物与医学生态学学科组马占山研究员邀请,美国科罗拉多大学丹佛分校临床免疫与传染病科主任 Prof. Brent Palmer 教授来昆明动物研究所做了题为:HIV-associated alterations in the gut microbiome:causes and consequences的学术报告。
目前关于HIV感染与肠道微生物菌群关系的研究是HIV研究领域的最新进展之一。 全世界发表的相关论文可能仅有10多篇。Palmer 教授在该领域的研究处于领先地位,其团队发表了该领域的第二篇论文。该领域之所以重要原因是,研究发现,目前治疗AIDS 药物最终失效的原因与肠道菌群有关。该药物会破坏肠道微生物菌群,加之HIV破坏免疫系统,从而导致肠道微生物入侵血液,病人自然无法得到救治。假设如果能够减缓该药物对肠道微生物破坏,抑制肠道菌群的“越界”,或许该药物就会有更好机会发挥效力。对于目前尚无有效药物的AIDS病治疗来讲,该研究领域的突破显然有着重要的临床意义。
Palmer 教授在报告中全面介绍了他们实验室在该领域的最新研究进展, 其中重要发现之一是:对于 HIV感染者来讲,通过饮食来调节肠道微生物比使用益生菌可能更为有效, 其原因是适宜的饮食可能会对免疫系统有良好的影响,而目前益生菌没有此类功能。
Palmer 教授还介绍了US-NIH关于 HIV 与 Virome 关系的最新研究计划。 Palmer 教授与同校Catherine Lozupone 合作团队已经获得了 NIH 首批关于 Virome-HIV关系研究的资助。 Catherine Lozupone 教授是国际知名的生物信息学家,其开发的 UniFrac 和 QIIME 系微生物宏基因组分析最常用的软件。计算生物学与医学生态学实验室目前正在分析 Palmer 实验室所获得的受SIV感染的macaques 肠道微生物宏基因组测序数据,并计划在未来有更为广泛的合作。