灵长目疣猴亚科(Colobinae)物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群,围绕其所包含的各属之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点。中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生王晓萍结合模式生物基因组信息,系统筛选得到44个新的单拷贝核基因
内含子片段,并结合线粒体基因组信息,开展灵长目疣猴亚科属间系统发育关系研究。核基因和线粒体基因组分析结果得到了不同的系统发育树拓扑结构:核基因结果支持在亚洲疣猴中,长尾叶猴属(Semnopithecus)属和乌叶猴属(Trachypithecus)聚为姐妹群,叶猴属(Presbytis)和奇鼻猴类群[the odd-nosed monkey;包括金丝猴属(Rhinopithecus),白臀叶猴属(Pygathrix)和长鼻猴属(Nasalis)]聚为姐妹群。而在奇鼻猴类群中,白臀叶猴属和金丝猴属的关系更近。线粒体基因组分析结果则支持亚洲疣猴中,长尾叶猴属最先分歧,奇鼻猴类群是叶猴属和乌叶猴属的姐妹群。而在奇鼻猴类群中,白臀叶猴属和长鼻猴属关系更近。另外一个重要的结果是所有分析结果都不支持最近提出的“非洲疣猴并系和杂交”的假说,支持非洲疣猴的单系起源。研究结果发表在《PLOS ONE》刊物上(2012, 7: e36274)。