核糖体是蛋白质合成的分子机器。核糖体RNA的加工成熟及其与核糖体蛋白的结合是核糖体亚基装配的基本过程。真核生物的该过程是在核仁中进行的。在酵母上已有报道核糖体小亚基rRNA（SSU rRNA）的加工成熟，是由一个被称为“SSU Processome”（小亚基rRNA加工体）的核酸蛋白复合体所完成。但该机制是否在真核生物普遍存在，该机制如何从没有核仁结构的原核细胞的基础上进化形成又如何随着真核生物的进化而不断完善和分化的，目前尚不清楚。

　　中国科学院昆明动物研究所真核细胞进化基因组学研究组冯金梅博士生在导师文建凡研究员的指导下，首先基于全基因组数据对真核生物五大超群中的77个代表物种和大量的原核生物（包括1375中真细菌和67种古菌）进行了SSU processome所有组分的同源搜索、鉴定和分子系统发生分析，揭示了如下重要规律：1）SSU Processome 广泛存在于各类真核生物中，是真核生物核糖体小亚基rRNA加工的普遍机制； 2）在真核生物的最近共同祖先（LECA）中即已进化出了较为完备的SSU Processome，其部分组分直接继承自古细菌、并发生古老的基因重复（duplication）和功能分化以形成一些新的组分（且包括产生了SSU Processome以外的一些核仁功能成分），而在此过程中真细菌基本没有任何直接贡献；3）大量的SSU Processome组分是在LECA的进化形成过程中产生的，主要通过从头形成、招募已有蛋白（包括真细菌和古细菌起源的）的结构域共同形成新的SSU processome组分；4）随着真核生物在LECA基础上的分化，SSU processome进一步发生基因重复、丢失，以及谱系特异性的获得等多种进化方式而在不同的真核生物类群中呈现出一定程度的多样性。

　　此外，本研究也进一步提示LECA 已是一个复杂的真核细胞，它已具有较完备的SSU processome，甚至已经出现了核仁结构。

　　以上研究结果对于揭示真核细胞如何在原核细胞的基础上进化形成具有重要的意义。有关论文已在“Genome Biology and Evolution”上在线发表（http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/07/gbe.evt173.full.pdf）。

　　该研究得到了国家自然科学基金重点项目，中科院创新知识重要方向项目和科技部973项目资助。