肿瘤是一种病因复杂且异质性极高的疾病,发病机制尚不完全清楚。快速发展的肿瘤大数据(如基因组及转录组数据)积累,为甄别新的肿瘤相关基因、深入理解肿瘤发生发展的分子机制提供了绝佳的契机。
中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组,通过分析来自TCGA (The Cancer Genome Atlas)数据库的12种肿瘤的转录组数据发现:ERCC6L基因在12种肿瘤中都非常一致地显著高表达。该基因是一个新近发现的DNA解旋酶,与胚胎发育息息相关,然而与肿瘤的关系却从未见报道。研究人员首先通过体外细胞实验发现,沉默ERCC6L可显著抑制乳腺癌细胞(MCF-7, MDA-MB-231)和肾癌细胞(786-0)的增殖,细胞周期被阻滞在G0/G1期。进一步分析ERCC6L敲降后的细胞转录组数据及验证实验发现:ERCC6L敲降可显著抑制RAB31基因的转录和翻译水平,同时降低RAB31下游的MAPK途径的磷酸化水平和CDK2的蛋白表达。为了验证体外实验结果,课题组进行了裸鼠成瘤实验,结果显示:沉默ERCC6L可于瘤细胞接种后的第七天就开始显著抑制肿瘤生长。不仅如此,ERCC6L表达水平与患者的肿瘤分期高度相关,且ERCC6L高表达可预示肿瘤患者的低生存率,提示ERCC6L是肿瘤预后的良好标记物,同时也是肿瘤治疗和药物开发的一个潜在靶点。该研究成果近期发表于Oncotarget杂志(http://www.impactjournals.com/oncotarget/index.php?journal=oncotarget&page=article&op=view&path%5B%5D=14998&path%5B%5D=47923)。课题组成员浦绍艳和博士研究生余琴为文章的共同第一作者,孔庆鹏研究员和何永捍副研究员为文章的并列通讯作者。
该项目得到了科技部973项目、国家自然科学基金及中国科学院等研究基金项目的支持。