黑冠夜鹭活动于湖泊、水库、河流等湿地边缘的沼泽浅滩和水田中，也见于田坝或居民区附近的乔木树上或竹丛上，常多只或数十只结群活动，以昆虫等动物性食物为食。繁殖期2~8月，常与白鹭等混群在树上营巢。云南大部分地区均有分布，为夏候鸟。列入《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》。