表型分析系统由行为分析分系统，基础生物学分系统，病理、药理和毒理分系统和影像分析分系统构成。该系统可完成灵长类实验动物个体静态层面的体貌特征、生长发育、组织结构、体液生理生化指标、细胞生理生化指标、营养代谢物成份等的常态测定，也可完成动物动态层面的行为分析、脑影像学结构和功能分析、活体心血管系统功能实时观测等。表型分析系统旨在建立具有国际先进水平的灵长类动物研究平台，多维度、多层次、多尺度的分析灵长类实验动物个体与群体表型行为和特征；建立灵长类模式动物的行业标准及评价体系；开展人类疾病灵长类动物模型的创建、机理解析与综合评价；基于灵长类动物模型的药理药效与毒理评价；可系统、精确地描述灵长类实验动物在可控环境下的表型变化。