时间:2022年4月22日(周五)14:00-16:00
地点:茨坝园区205报告厅
报告题目:Dynamics-based data science in biology —— Three examples
报告人:史际帆
主持人:刘振 研究员
报告人简介:
史际帆,2018年获北京大学计算数学博士学位;2018年4月至2020年3月任东京大学生产技术研究所数理生命情报学研究室特任研究员;2020年4月至2022年3月任东京大学国际高等研究所神经智能国际研究机构特任研究员。主要研究方向为基于动力学的生物数据建模与分析,具体包括:单细胞测序数据建模与分析,生物复杂网络推断,临界现象分析与疾病的早期预警等。研究成果在 Briefings in Bioinformatics, PLoS Computational Biology, National Science Review, Journal of the Royal Society Interface 等杂志发表。
报告摘要:
本报告将使用三个例子介绍基于动力学的数学模型在生物系统中的应用。(1)马氏动力学在单细胞数据中的应用:我们将介绍马氏熵的概念,并用它来度量“单”细胞的多潜能性。(2)因果动力学在生物数据中的应用:我们将定义动力学因果的数学框架,介绍新的度量变量之间因果关系的嵌入熵指标,并应用到传染病、生物链等实际数据中。(3)临界动力学在EEG数据中的应用:我们将使用正常人、高危人群、精神分裂症患者的EEG数据,支持正常大脑的“临界态猜想”,并指出高危人群存在的特殊动力学特征。
进化与发育研究中心
遗传资源与进化国家重点实验室
中国遗传学会进化遗传学分会
进化发育生物学研究组