张晓明（哈尼族），博士，研究员，博士生导师；国家优秀青年基金获得者，云南省青年拔尖人才，中国科学院优秀博士和优秀毕业生，曾获中国科学院院长奖优秀奖和云南省优秀博士论文奖，致力于东亚人群的起源与迁徙历史和适应性进化的分子机制研究；从线粒体DNA、Y-DNA到全基因组分析，从生物信息学大数据挖掘到模式动物和细胞功能验证，再到现生人群和史前人类（古DNA）的时空研究方法，探讨东亚地区人类的群体历史及其环境适应的分子机制，从遗传学、古人类学/考古学、古气候学和地理学等交叉科学的视角，揭示东亚早期人类的复杂表型背后的分子机制和群体历史及其与环境适应的关系。研究结果发表在《Nature》、《PNAS》、《Nature Communications》、《Current Biology》、《National Science Review》、《Molecular Biology and Evolution》和《iScience》等国际知名SCI期刊上。应邀为《Nature Communications》、《Science Advances》、《Cell Reports》、《Chinese Science Bulletin》、《Molecular Biology and Evolution》、《American Journal of Physical Anthropology》、《人类学报》、《Genome Biology and Evolution》、《European Journal of Human Genetics》、《Journal of Systematics and Evolution》、《Scientific Reports》、《Human Biology》、《Journal of Human Genetics》、《Molecular Genetics and Genomics》《Journal of Genetics and Genomics》和《Frontiers in Genetics》等20余种SCI科学期刊审稿。

经历

2003.09 - 2007.06  学士学位（动物科学），西北农林科技大学动物科技学院

2007.09 - 2010.06  硕士学位（遗传学），西北农林科技大学动物科技学院

2010.07 - 2011.08  研究实习员，比较基因组学，遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

2011.09 - 2014.06  博士学位（遗传学），中国科学院大学/中科院昆明动物研究所

2014.07 - 2015.09  助理研究员，比较基因组学，遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

2015.10 - 2017.12  副研究员（三级，破格），比较基因组学，遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

2018.01 - 2021.08  副研究员（二级），比较基因组学，遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

2021.09 - 2022.10  研究员（四级），遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

2022.10 - 至今     研究员（PI），遗传资源与进化国家重点实验室，中国科学院昆明动物研究所

方向一

基于古老基因组的人类遗传多样性研究。以古DNA为手段，揭示东亚及东南亚地区考古遗址中早期人类的遗传多样性。依托现代人群基因组大数据探讨人类在该地区早期的定居、迁徙、文化交流和遗传多样性形成的过程，及在该过程中人类适应不同地理生态环境的遗传机制。

方向二

结合古代群体和现生群体的大型哺乳动物群体历史和生物地理学研究。结合考古遗址中动物遗骸的古DNA研究，探讨史前大型哺乳动物群体与现生群体的遗传关系，从而解析这些动物的遗传多样性动态变化的历史，揭示从古至今大型哺乳动物的大尺度地理时空分布、史前迁徙和物种间遗传交流和混合的历史，及其与古气候、古生态环境变化和早期人类活动的相互关系。

1.2022年 国家自然科学优秀青年基金获得者

2.2019年 云南省兴滇人才支持计划“青年拔尖人才”

3.2016年 云南省优秀博士论文奖

4.2014年 中国科学院院长奖优秀奖

5.2014年 中国科学院优秀博士毕业生

6.2014年 中国科学院“三好学生”标兵

7.2013年 中国教育部国家奖学金（博士）

1.国家自然科学基金：中国西南晚更新世以来大型旗舰哺乳动物多样性古DNA研究，U23A20161，2024-01至2027-12，256万元，主持；

2.国家自然科学优秀青年基金：东亚早期人类的表型演化分子机制与群体历史，T2222030，2023-01至2025-12，200万元，主持；

3.科技部国家重点研发计划：2022-11至2025-10，600万元，项目主持；

4.国家自然科学基金，面上项目：东南亚土著人群的源流历史与特征表型适应性进化的遗传学研究，31871258，2019-01至2022-12，60.0万元，主持;

5.“云南省万人计划-‘青年拔尖人才’”项目：华南地区新-旧石器时代过渡阶段人类基因组遗传多样性的古DNA研究，YNWR-QNBJ-2019-160,2020.01至2024.12，50万元，主持；

6.国家自然科学基金，青年基金项目：青藏高原史前人类高原适应的遗传机理和迁徙与定居历史的古DNA研究，31601018，2017-01至2019-12，21万元，主持;

7.中国科学院“西部之光”博士项目,2014-07至2017-12，20万元，主持;

8.国家自然科学基金，国际（地区）合作重点项目：史前人类对青藏高原北部高寒缺氧环境的适应过程和模式研究，41620104007，2017-01至2021-12，260万元，科研骨干。

近5年内发表的代表性论文/专著

1.Ningbo Chen^#,Lele Ren^#,Linyao Du^#,Jiawen Hou^#,……,Bing Su^*,Guanghui Dong^* and Xiaoming Zhang^*. Ancient genomic DNA evidence reveals the presence of tropical bovid species in northeastern Tibetan Plateau contributed to the prevalence of hunting games until the late Neolithic. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS),117(45):28150-28159(2020)(ImpactFactor:10.620)(古代基因组证据揭示热带牛科动物在青藏高原东北部的栖息对人类的狩猎行为盛行到新石器时代晚期有重要的贡献)（作为交叉学科合作研究并取得重要发现的范例，该成果发表后受到了多个领域和公众的广泛关注，相继被CCTV新闻频道（科技新闻）、中科院官网、新华社国际网、美国科学促进会（AAAS）、科普中国、科学网、中新网和科技日报等20多个主流媒体和宣传平台报道）

2.Yaoxi He^#, Xiaoming Zhang^#, Min-Sheng Peng^#, Yuchun Li^#, Kai Liu^#, ……Consortium of Anthropological Research in Southeast Asia and Southwest China (CASEAC), Qingpeng Kong^*, Ya-Ping Zhang^1,3,4,34*, Bing Su^1,2,33*. Genome diversity and signatures of natural selection in mainland Southeast Asia. Nature (2025年5月),In Press

3.Xiaoming Zhang^#,Xueping Ji*,Chunmei Li^#,…… Yaoxi He*, and Bing Su*. A Late Pleistocene human genome from Southwest China. Current Biology,32,1–15(2022)(ImpactFactor:10.900)（中国西南地区晚更新世的一个人类基因组）（报道了1.4万年前的云南马鹿洞“蒙自人”的基因组数据及其起源和迁徙历史，受到国内外媒体和大众的广泛关注）

4.Xiaoming Zhang^#,Qi Liu^#,Hui Zhang^#,Shilei Zhao^#,……,Bing Su*,Hua Chen*. The distinct morphological phenotypes of Southeast Asian aborigines are shaped by novel mechanisms for adaptation to tropical rainforest. National Science Review, nwab072(2021) (ImpactFactor:16.693)(东南亚土著人群的特征表型由热带环境适应的新遗传机制所编译)

5.Xiaoming Zhang^#,Chunmei Li^#,Yanan Zhou^#,…… Rasmi Shoocongdej*,Xueping Ji*and Bing Su*；A Matrilineal Genetic Perspective of Hanging Coffin Custom in Southern China and Northern Thailand. iScience, 23,101032,(2020).(ImpactFactor:5.458)（母系遗传视角下的中国南方和泰国北部悬棺葬习俗研究）（该成果发表后受到了社会公众的广泛关注，被CCTV-13&CCTV4频道（长视频报道）、中新网、新华网、学习强国平台和环球网等30多个主流媒体报道。该论文入选了细胞出版社（CellPress）交叉科学领域“2020中国年度论文”，还被《iScience》杂志于2021年列为杂志创刊以来最具影响力的Top10研究成果之一（位列第七）

其他代表性论文/专著

1.SushilBhandari#,XiaomingZhang#,ChaoyingCui#,Yangla,LanLiu,Ouzhuluobu,Baimakangzhuo,Gonggalanzi,CaijuanBai,Bianba,YiPeng,HuiZhang,KunXiang,HongShi,ShimingLiu,Gengdeng,TianyiWu,XuebinQi*&BingSu*.Sherpas share genetic variations with Tibetans for highaltitude adaptation.Molecular Genetics & Genomic Medicine.5(1):76–84,doi:10.1002/mgg3.264(2017)(ImpactFactor:2.742)（夏尔巴人与藏族共享高原适应的遗传变异）

2.Yang,Zhaohui#；Zhong,Hua#；Chen,Jing#；Zhang,Xiaoming#；Zhang,Hui；Luo,Xin；Xu,Shuhua；Chen,Hua；Lu,Dongsheng；Han,Yinglun；Li,Jinkun；Fu,Lijie；Qi,Xuebin；Peng,Yi；Xiang,Kun；Lin,Qiang；Guo,Yan；Li,Ming；Cao,Xiangyu；Zhang,Yanfeng；Liao,Shiyu；Peng,Yingmei；Zhang,Lin；Guo,Xiaosen；Dong,Shanshan；Liang,Fan；Wang,Jun；Willden,Andrew；Aun,HongSeang；Serey,Bun；Sovannary,Tuot；Bunnath,Long；Samnom,Ham；Mardon,Graeme；Li,Qingwei；Meng,Anming*；Shi,Hong*；Su,Bing*；A Genetic Mechanism for Convergent Skin Lightening during Recent Human Evolution,Mol.Biol.Evol.33(5),1177-1187.(2016)(ImpactFactor:9.857)（人类近期进化历史中肤色变浅的遗传学机制）

3.SushilBhandari#,XiaomingZhang#,ChaoyingCui#,Bianba,ShiyuLiao,YiPeng,HuiZhang,KunXiang,HongShi,Ouzhuluobu,Baimakongzhuo,Gonggalanzi,ShiminLiu,Gengdeng,TianyiWu,XuebinQi*&BingSu*2015.Genetic evidence of a recent Tibetan ancestry to Sherpas in the Himalayan region.SciRep5:16249.10.1038/srep16249(2015)(Co-Firstauthor)(ImpactFactor:5.597)（遗传学证据揭示喜马拉雅山地区夏尔巴人是晚期从藏族分化的人群）

4.ZhangXM#,QiXB#,YangZH#,Serey,BSovannary,TBunnath,L,HSeangAun,HSamnom,ZhangH,LinQ,MVanOven,ShiH*.&SuB*.Analysis of Mitochondrial Genome Diversity Identifies New and Ancient Maternal Lineages in Cambodian Aborigines.Nat Commun 4,2599,(2013).(ImpactFactor:10.20)（柬埔寨土著人群的线粒体基因组分析发现新而古老的人类母系世系）

5.QiXB#,CuiCY#,PengY#,ZhangXM#,YangZH,ZhongH,ZhangH,XiangK,CaoXY,WangY,Ouzhuluobu,Basang,Ciwangsangbu,Bianba,Gonggalanzi,WuTY,ChenH,ShiH*.&SuB*.Genetic Evidence of Paleolithic Colonization and Neolithic Expansion of Modern Humans on the Tibetan Plateau.Mol.Biol.Evol.30,1761-1778,(2013).(Co-Firstauthor)(ImpactFactor:9.857)）（遗传学证据揭示人类在旧石器时代定居和新石器时代扩张到青藏高原的历史）