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侯春晖研究员

进化发育与四维基因调控学科组

职　　务：

学　　历：

电　　话：

传　　真：

电子邮件：

houchunhui@mail.kiz.ac.cn

通讯地址：

云南省昆明市盘龙区茨坝街道龙欣路17号 650201

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简　　历

侯春晖，理学博士、博士生导师、国家高层次人才引进计划入选者、深圳市孔雀人才计划B类。1997年毕业于复旦大学生命科学学院，获理学学士学位；2004年毕业于中国科学院上海生化细胞所，获理学博士学位；2004-2009年在美国国立卫生研究院做访问学者；2009-2013年在美国埃默里大学生物系做博士后研究；2013年入选国家高层次人才引进计划，任南方科技大学生物系副教授。以通讯作者和第一作者在Nature Genetics ，Molecular Cell，PNAS等国际著名杂志发表研究论文和评论17篇，共同作者论文15篇，主持和参与国自然、科技部重点专项、广东省和深圳市等多项基金研究。

研究方向

1. 基因组三维空间结构的建立过程、建立机制，及与基因调控之间的关系

2. 多种类型顺式调控元件组的功能性鉴定、遗传和表观遗传特征分析、顺式调控元件预测，以及作用机制研究

3. 发育和疾病发生过程中基因组三维空间结构和调控元件组相互作用动态变化协同控制基因表达的机制

4. 调控元件组及基因组三维空间结构在进化过程中的演变

承担科研项目

专家类别

研究员

社会任职

获奖及荣誉

代表论著

*通讯作者

1． Longjian Niu^#, Wei Shen^#, Zhaoying Shi^#, Yongjun Tan, Na He, Jing Wan, Jialei Sun, Yuedong Zhang, Yingzhang Huang, Wenjing Wang, Chao Fang, Jiashuo Li, Piaopiao Zheng, Edwin Cheung^*, Yonglong Chen^*, Li Li^*, Chunhui Hou^*. Three-dimensional folding dynamics of the Xenopus tropicalis genome. Nature Genetics, 2021 Jul; 53(7), 1075-1087.

2． Longjian Niu^#, Wei Shen^#, Yingzhang Huang^#, Na He, Yuedong Zhang, Jialei Sun, Jing Wan, Daxin Jiang, Manyun Yang, Yu Chung Tse, Li Li*, Chunhui Hou*. Amplification-free preparation of library with SAFE Hi-C uses ligation products for deep sequencing to improve traditional Hi-C analysis. Communications Biology, 2019 Jul 19; 2:267.

3． Jialei Sun^#, Na He^#, Longjian Niu^#, Yingzhang Huang^#, Wei Shen^#, Yuedong Zhang, Li Li, Chunhui Hou*. Global Quantitative Mapping of Enhancers in Rice Genome by STARR-seq. Genomics, Proteomics and Bioinformatics, 2019 Apr; 17(2): 140-153.

4． Li Li^#, Xiaowen Lyu^#, Chunhui Hou^#, Naomi Takenaka, Huy Q. Nguyen, Chin-Tong Ong, Caelin Cubenas-Potts, Ming Hu, Elissa P. Lei, Giovanni Bosco, Zhaohui S. Qin, and Victor G. Corces*. Widespread rearrangement of 3D chromatin organization underlies Polycomb-mediated stress-induced silencing. Molecular Cell, 2015 April 16, 58(2): 216-231. (^#co-first author).

5． Hou C^#, Li L^#, Qin ZS*, Corces VG*. Gene density, transcription, and insulators contribute to the partition of the Drosophila genome into physical domains. Molecular Cell, 2012 Nov 9; 48(3):471-84. (#co-first author).

6． Hou, C.H. and Corces, V.G. Nups take leave of the nuclear envelope to regulate transcription. Cell, 140 (3): 306-308, 2010.

7． Hou, C.H., Dale, R. and Dean, A. Cell type specificity of chromatin organization mediated by CTCF and cohesin. PNAS, 107 (8): 3651-3656, 2010.

8． Hou, C.H., Zhao, H., Tanimoto, K. and Dean, A. CTCF-dependent enhancer blocking by alternative chromatin loop formation. PNAS, 105 (51): 20398-20403, 2008.

研究团队