狼（Canis lupus）是家犬的野生祖先，是广泛分布的陆生哺乳动物，占据了欧亚大陆、北美、乃至北非等地。前人的研究表明狼具有复杂的系统发育和群体历史，不仅受地理和生态环境影响存在群体结构，而且和家犬、郊狼（Coyote）、乃至豺存在明显的、长期的基因交流和群体混合现象。在中国，狼不仅生活在青藏高原、东北、新疆、内蒙等地，而且在中国的南方也有分布（Lu Wang et al. 2016.Zoological Research）。 

　　为了系统研究中国南方狼的系统发育地位和群体历史，我们首先和中国科学院动物研究所国家动物博物馆，中国科学院昆明动物研究所昆明动物博物馆联系，取得了浙江、江西、贵州等中国南方的狼皮张样本，以及来自黑龙江和吉林的皮张样本。随后，中国昆明动物所分子进化与基因组多样性课题组与中国科学院古脊椎所古DNA实验室合作，提取了皮张样本的DNA并全基因组测序。群体遗传学分析发现中国南方的狼是一个单独的群体，和中国北方、青藏高原狼有差异且关系最近。其次，我们发现采自浙江的狼个体基因组中存在一种遗传组分，可能来自于犬科的另一个物种，且分歧时间大于狼和亚洲豺犬（Cuonalpinus）。我们的结果亦揭示犬科物种间的基因交流在物种形成过程中扮演了重要的作用，也提示古DNA的研究方法对动物博物馆馆藏样本有显著的研究意义。该研究成果2019年9月11日在线发表于Cell旗下子刊iScience上(https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(19)30345-1)。 

　　中国科学院昆明动物研究所王国栋研究员，中国科学院古脊椎所张明博士为文章的共同第一作者，中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、中国科学院古脊椎所付巧妹研究员为共同通讯作者。该研究得到了中国科学院B类战略性先导科技专项、国家自然科学基金重大研究计划、霍华德修斯医学研究所（付巧妹）和中科院青年创新促进会（王国栋）的支持。 

中国南方狼的系统发育关系和基因交流