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院重点实验室成功举办彩云医药讲坛2021年第3期
2021-06-29 来源:精神疾病遗传及功能基因组学 作者:刘杰伟

  2021625日上午, 由中国科学院动物模型与人类疾病机理重点实验室(以下简称院重点实验室)主办的 彩云医药讲坛”2021年第3期在昆明动物研究所举行,主讲者为来自中国科学院北京生命科学研究院的赵方庆研究员。论坛由院重点实验室罗雄剑研究员主持。 

  赵方庆现任中国科学院北京生命科学研究院研究员,中科院北京生科院科研部副主任,技术平台部主任,中国生物工程学会生物信息学与计算生物学专委会副主任。先后获得基金委优秀青年基金(2017)、北京市杰出青年科学基金(2018),国家杰出青年科学基金(2020)等资助。赵方庆研究员主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与人类健康和疾病的关系。目前在CellNature BiotecnologyGutNature CommunicationsGenome biology等刊物上发表通讯作者论文40余篇,平均影响因子超过13,研究论文总引用次数超过8000次(H-index 41),其中10余篇入选ESI高被引论文。 

  赵方庆研究员作了题为生物大数据挖掘技术的精彩学术报告,报告分成两个部分。在报告的第一部分中,赵方庆研究员为大家介绍了他们实验室近年来在环形RNA方面的工作。首先是在环形RNA识别算法方面,提出了不依赖参考基因组注释信息的环形RNA识别技术;紧接着是环形RNA新特征及转录本重建的算法,该方法解决了环形转录本内部结构重建的难题;然后是环形RNA精确定量和差异表达的新的分析策略;最后通过对环形RNA的多样性保守性剪接模式,以及与线性RNA成环比等多维度分析,建立了环形RNA的功能注释新方法。这些算法工具为研究人员理解环形RNA的多样性,形成机制及功能研究奠定了方法学基础。报告的第二部分是关于微生物组学方面的工作,通过对菌群结构解析,功能基因挖掘,菌群动态追踪三个方面的工作介绍,让大家对微生物组学分析中的拼接,编码基因的重建和注释,以及微生物之间的相互作用,菌群溯源等方面的相关新技术新方法有了初步的了解。 

  赵方庆研究员的报告内容系统深入,让大家领略了生物大数据挖掘技术的科研思维。罗雄剑研究员、石磊研究员、李明研究员等多位研究所科研人员参加报告会。赵方庆研究员与到场师生们进行了热烈的学术交流。报告结束后,赵方庆研究员还与罗雄剑研究员及其他相关研究人员进行了进一步的交流讨论。 

赵方庆研究员作报告 

报告后交流讨论 


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