2024年8月13日,应生物多样性基因组中心王国栋研究员的邀请,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心王开乐研究员到昆明动物研究所进行学术交流,以“高通量单细胞DNA测序及高精准二代测序方法检测罕见肿瘤克隆群体”为题做了一场学术报告。
王开乐研究员的主要研究领域为单细胞DNA测序、单细胞多组学测序、空间组学测序方法的开发及其在癌症研究中的应用。在此次报告中主要介绍了他们开发的三种基于高通量测序的方法(oseq、Droplet-Cirseq、o2n-seq),这些方法可检测肿瘤及其癌旁组织中的极低频突变位点。利用上述技术,他们在肝癌患者的肿瘤组织和相邻正常组织中发现了新的超低频突变。
此外,还介绍了他们开发的首个能对 FFPE(甲醛固定石蜡包埋)组织进行高通量单细胞 DNA 测序的方法(Arc - well)。该技术不仅适用于细胞系和冷冻组织,还能对保存了几十年的FFPE癌症样本进行高质量的测序。通过对原发性乳腺导管内癌(DCIS)及复发癌症患者的单细胞DNA测序数据分析,他们发现了原发性DCIS病例的全基因组倍增、克隆多样性,以及与复发中持续亚克隆的共享基因组谱系,发现了复发乳腺癌中来源于原位乳腺导管癌的残留肿瘤亚克隆群体,鉴定了跟复发相关的基因组变异事件,推测了由原发到复发的肿瘤演化模型。
王开乐研究员及其团队的研究成果不仅为肿瘤克隆群体的研究提供了新的视角和工具,也为深入理解肿瘤发生、发展及复发机制提供了重要线索。报告结束后,王开乐研究员与现场师生进行了热烈的讨论和交流,并对大家提出的问题进行了详细解答。