中国科学院昆明动物研究所始建于1959年4月，其前身为昆虫研究所紫胶站，1963年改名为中国科学院西南动物研究所，1970年划归云南省后改名为云南省动物研究所，1978年重归中国科学院，恢复现所名。 

　　1996年昆明动物研究所设立生物学博士后科研流动站，截至目前，科研流动站共招收博士后68人。昆明动物研究所生物学博士后科研流动站致力于加强自身科研能力和平台建设，积极为博士后创造开展科研工作的良好条件。昆明动物所现有31个学科研究团组，有“遗传资源与进化国家重点实验室”、“中国科学院-云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室”、中国科学院与云南省共建的“动物生殖生物学重点实验室”和“畜禽分子生物学重点实验室”，以及与国内外高校、科研机构共建的多个实验室等，并建有中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心等联合共建科研平台。 

　　昆明动物研究所生物学博士后科研流动站积极参与地方人才培养工作和面向东南亚的科研合作，流动站现有28位中、外博士后在站开展研究工作，其中8位博士后为云南本地高校毕业或单位工作的科研人员，1位来自泰国。同时，流动站还与地方科研机构展开合作，联合培养博士后研究人员，2013年与云南省肿瘤医院通过流动站与工作站联合招收博士后的方式开始合作培养博士后研究人员。