等位基因特异的RNA编辑研究取得新进展
2018-07-16 | 作者: | 来源: 【打印】

  中科院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心成员张亚平院士领导的团队研究了人类和小鼠各种组织中等位基因特异的RNA编辑情况。研究团队在人中鉴定出315个等位基因特异的RNA编辑位点,且这些位点在不同组织中有相当比例的重叠。同时,利用远源杂交的小鼠,鉴定到184个等位基因特异的RNA编辑位点,并发现在不同的杂交组合中有相当比例的重叠,这提示他们的鉴定方法是可信的,并证明等位基因特异的RNA编辑是广泛存在的。 

  细胞实验证实SNP会引起等位基因特异的RNA编辑

 

  有意思的是,在鉴定的等位基因特异的RNA编辑位点中有部分位点引起了氨基酸的改变,然而,与之临近的SNP却为同义突变。细胞水平的突变实验揭示这些同义突变的位点会影响RNA编辑的编辑效率(如图),也就是,同义突变的SNP会导致引起氨基酸改变的RNA编辑表现为等位基因特异的修饰。进一步的SHAPE实验揭示,SNP通过影响RNA二级结构从而产生等位基因特异的RNA编辑。该工作为等位基因特异的RNA编辑研究提供了一个成功的范例,也为解释和疾病以及性状改变相关的同义突变提供了新的思路。  该研究工作以“Genome wide analyses uncover allele-specific RNA editing in human and mouse”为题,在线发表于国际知名期刊Nucleic Acids Research (https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gky613/5052368)。 

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