保护滇金丝猴的重要意义可概括为以下五点：

1． 它是重要的旗舰物种：滇金丝猴有着一副世间最象人的“相貌”，天生丽质，显得十分乖巧和灵性通人，且全身上下为黑白双色所构成的图案，与大熊猫一样，简洁明快，惹人喜爱，从而容易赢得人们的赞誉和怜悯。特别是自从1999年昆明世界园艺博览会把滇金丝猴作为其吉祥物之后，滇金丝猴在人们心中的地位迅速上升，它在各种媒体上的报道日益增多，已逐渐成为明星物种。

2． 它是重要的指示物种：滇金丝猴的生存有赖于原始森林，并且每个滇金丝猴的活动面积都特别大，需要百平方公里以上的原始森林方能生存，其家域之大在中国乃至全球所有灵长类动物当中屈指可数，所以滇金丝猴群完全可视为大面积原始森林的存在标志，即凡有滇金丝猴群的地方也就表明这里尚存有绵延数百平方公里的原始森林。这样，我们通过对滇金丝猴的保护来实现对这些大面积原始森林的保护。

3． 它是重要的保护伞物种：滇金丝猴的生存对于大面积原始森林的依赖程度远比它所存在地域内的其动植物要高得多，如果我们所采取的保护行动之成效将能够使其生境满足于滇金丝猴的生存需求的许，就一定可以满足许多与之共同生活在这些原始森林中的生命体的保护需求，从而使它们都得到很好的保护，得以永续生存繁衍下去。

4． 它是重要的关键物种：滇金丝猴食物种类的主要成份之一是当地温性针叶林或混交林中各类高大乔木树上所附生的树挂地衣。这些附生地衣对于当地森林的健康状况有着明显的影响，因此滇金丝猴的存在有助于这些原始森林的健康状况改善。

5． 它有着特殊重要学术研究价值：滇金丝猴是灵长类动物中海拔分布最高者，终年生活在雪线附近的冷杉林中，以地衣、竹笋、嫩枝及苔藓为食，是四种金丝猴中特化程度最高的物种，也是亚洲疣猴亚科中物种特化之最。这种特殊生态适应，造成其生态行为学极为独特且世人对此知之甚少。所以，研究滇金丝猴对于了解亚洲灵长类的分化和进化具有重要的意义和极高的学术价值。

滇金丝猴生存面临的挑战：

1．　 尚未制定出具有总体指导意义的“滇金丝猴保护行动计划”。所以，难以协调针对该物种的各项保护活动及对其相关资源进行统一调配。

2．　 当前的自然保护区体系尚不足以满足滇金丝猴的保护需求。迄今为止，有些重要的猴群仍不在保护区内，故仅得到了“口号式”的保护。近来研究表明：这种状况已造成了两个猴群的彻底消亡。