1958年
任昆明动物研究所首任所长

1949年任北京农业大学昆虫学系主任。1952年调入中国科学院实验生物研究所昆虫研究室（即昆虫研究所前身）。是年，美国在侵朝战争中悍然使用细菌武器。刘崇乐受命参加“美帝国主义细菌战罪行调查团”前往中朝边境调查取证。他以精湛的学识和分折能力查获了美军撒播带菌昆虫，危害和平居民的种种罪行，向国际科学委员会提出了有力的证据。

50年代起，刘崇乐立足于昆虫学基础知识的丰富积累，密切结合经济建设大发展的需要，在国内首倡资源昆虫学研究。他积极从事捕食性天敌昆虫的应用和开发研究；进行寄生蜂、寄生蝇的利用，为我国综合治理农业、林业和园艺害虫作出了贡献，是我国生物防治研究的先驱。

1955年以来，刘崇乐密切关注我国工业、国防的重要原料紫胶虫的研究。时值帝国主义国家对新中国实施禁运封锁，紫胶来源十分困难。1955－1958年间，刘崇乐出任中苏科学院联合组织的云南紫胶考察队队长，率中苏科学家和我国有关产业部门及云南省科技工作者百余人，进行了连续多年的综合性考察，为紫胶虫的人工放养、产区的扩大、产量的提高作出了卓有成效的贡献。

1956年，中苏科学院云南紫胶工作队改名为中苏云南生物资源考察队。除紫胶之外，调查研究扩充到动植物区系和资源。动物方面涉及昆虫、鱼类、两栖爬行类、鸟类和兽类。上述调查获得了诸多新发现，证实了云南动物种类繁且区系复杂、资源丰富。“动物王国”之称誉被科学界确认，为云南建立专业性的动物学研究机构作出了奠基性的准备。

刘崇乐一生热爱昆虫学研究。早期以胡蜂科为主要对象，中后期侧重于瓢虫科和寄生蜂、寄蝇、蜘蛛的研究。他刻苦好学，知识渊博、精通外语、广收昆虫文献并极有研究。他学风严谨、做事认真，严于自律又诲人不倦，受到同仁的普遍敬重。在其一生的教育、科研生涯中，著述甚丰。在中外刊物发表论文53篇，撰写学术专著6部，译著2部。

刘崇乐毕生热爱科学、热爱祖国，拥护中国共产党的领导。解放初，他作为民主同盟中央常务委员会委员，广泛团结同仁，为社会主义建设进言献策，身体力行参加社会主义建设。在飞机灭蝗、反细菌战、农林害虫防治，紫胶虫调查及资源开发系列工作中，以其深厚的学科知识为基础，出色地解决了国家面临的一些重大问题，为科学界的理论联系实践做出了令人敬佩的贡献，受到国家和人民的敬仰。