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李学燕   副研究员
进化基因组学与基因起源学科组
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  简  历

简历

1996年来一直开展昆虫学研究。昆虫是地球上物种多样性最丰富的类群,且与人类的生活生产有着紧密的关系。因此,理解纷繁复杂的昆虫学种类及其适应进化关系,是人类理解生命进化的关键主题之一,是为人类的生活生产提供重要的理论基础和实践依据的前提。自2002年进入昆明动物研究所以来,一直致力于以萤火虫和蝴蝶等昆虫为研究对象,从昆虫分类研究入手,根据分类学的内在规律并结合组学和遗传操作技术等各种研究手段试图探讨阐明物种适应进化的科学问题,如萤火虫等发光甲虫生物荧光起源与进化、蝴蝶等昆虫形态适应性进化的遗传基础与分子机制等,旨在促进昆虫分类和进化研究,解决昆虫学中长期以来的难题。涉及研究方向包括昆虫分类与分子系统学、生物荧光学、昆虫基因组与进化、昆虫遗传操作等。至今共发表昆虫分类和系统进化、基因组学及遗传操作等相关论文近30多篇(其中第一作者SCI论文8篇,通讯或末位通讯作者论文SCI论文15篇,单篇影响因子最高为11.329 (Nature Communications),累计发表当年影响因子为45);主持14项(国家自然科学基金面上项目2项(1项在研,1项结题)、云南省自然基金4项(2项在研,2项结题)、中科院项目2项(已结题)、所青年人才项目1项(已结题)、其它5项);参加项目11项(包括国家自然科学基金创新群体、国际合作、科技部973项目等)。 

学习和工作经历

2016/01-至今, 副研究员,中国科学院昆明动物研究所,进化基因组学与基因起源研究组,研究兴趣:蝴蝶和萤火虫等昆虫组学研究 

2009/11-2015/12, 助理研究员,中国科学院昆明动物研究所,进化基因组学与基因起源研究组,研究兴趣:蝴蝶和萤火虫等昆虫组学研究 

200711月至200911月,日本产业综合技术研究所(关西中心,大阪),博士后研究,研究兴趣:短寿命荧光素酶和细胞发光的测定技术的开发

20057月至200710,中科院昆明动物研究所,助理研究员,研究兴趣:发光甲虫的分类与昆虫分子系统学

20029-20057,中国科学院昆明动物研究所,博士研究生,研究兴趣:萤火虫分类与分子系统学200410-11日本产业综合技术研究所访问学习) 

19997-20029,云南农业大学植物保护学院,助教/讲师,从事昆虫学的教学与科研工作,研究兴趣:食蚜蝇在生物防治中的应用

19969-19997,云南农业大学昆虫系,硕士研究生,昆虫学,研究兴趣:食蚜蝇在生物防治中的应用

19929-19967,云南大学生物系,本科。1994-1996年参与花卉植物组织培养研究工作。 

  研究方向

主要以蝴蝶、发光昆虫等有重要表型特征的昆虫为研究对象,围绕物种系统发育和演化、基因组的进化机制、重要表型特征起源和进化等的遗传基础等进行研究,探讨昆虫的一些重要生命现象,试图在厘清昆虫系统发育关系的同时,解决重要的昆虫学的生物学问题。现阶段主要有以下研究方向: 

1、以蝴蝶为例,整合多层次组学数据和实验数据,探讨蝴蝶表型特征多样性的演化。为了探讨形态多样性的遗传分子机制,自2010年开始,发展蝴蝶作为研究模式。我们在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其近缘种柑橘凤蝶两种凤蝶基因组,并以蝴蝶为例成功实现了野生昆虫基因编辑。在以蝴蝶作为研究模式的基础上,一方面继续以这两种生物为模式,通过基因编辑方法探讨基因对形态的影响,另一方面于2017年启动了蝴蝶系谱基因组计划,我们希望在一个大尺度的系统发育框架下,探讨蝴蝶重要表型特征的起源和进化,从而揭示蝴蝶多样性的遗传基础,并为蝴蝶在生态环境保护中的应用提供理论参考和实验基础。 

2、以发光甲虫为例,开展发光甲虫的分类和系统发育研究,探讨生物荧光的起源与演化。我们自2002年开始以萤火虫等发光甲虫为研究对象,搭建和完善中国发光甲虫系统分类框、探讨萤火虫等发光甲虫的系统发育和演化,并在系统发育框下,整合多层次组学数据和实验数据,探讨发光甲虫及生物荧光起源与进化,我们旨在揭示生物荧光这一重要生命现象的遗传本质,同时也为萤火虫及其生物荧光的利用提供重要的理论基础和实践依据。 

3、其它重要昆虫的研究。利用本实验室已搭建的现代昆虫学研究平台,我们也将对其它一些具有重要表型特征或重要价值的昆虫进化研究,通过对更多类群的探讨,揭示昆虫多样性及表型特征进化的遗传分子基础。 

  承担科研项目

1.云南发光甲虫物种多样性及生物荧光进化的遗传基础研究,2021.04.01-2024.03.31(在研),云南省科技厅重点项目,50万,负责人

2.中青年学术和技术带头人后备人才项目李学燕,2021.01.01-2025.12.31(在研),云南省科技厅两类人材项目,6万,负责人

3.蝴蝶翅色多样性的进化发育的遗传基础研究,2021.01-2024.12 (在研),国家基金委面上项目,58万,负责人

  专家类别
  社会任职

中国昆虫学会第十一届理事会理事,中国昆虫学会第十一届理事会蛾类专业委员会副主任,中国昆虫学会第十一届理事会甲虫专业委员会委员,中国昆虫学会第十一届理事会蝴蝶分会委员,云南省昆虫学会第十一届理事会副理事长兼秘书长

  获奖及荣誉
  代表论著

(#第一作者,*通讯作者)

1.Li XY#, Fan DD#, Zhang W#, Liu GC#, Zhang L#, Zhao L, Fang X, Chen L, Dong Y, Chen Y, Ding Y, Zhao RP, Feng MJ, Zhu Y, Feng Y, Jiang XT, Zhu DY, Xiang H, Feng XK, Li SC, Wang J, Zhang GJ, Kronforst MR*, Wang W*. 2015. Outbred genome sequencing and CRISPR/Cas9 gene editing in butterflies. Nature Communications. 6: 8212. (2015, IF=11.329, 5year-IF =12.001)

2.Yang J#, Wan WT#, Xie M#, Mao JL#, Dong ZW#, Lu SH, He JW, Xie FA, Liu GC, Dai XL, Chang Z, Zhao RP, Zhang R, Wang ST, Zhang YM, Zhang W*, Wang W*, Li XY*. 2020. Chromosome-level reference genome assembly and gene editing of dead leaf butterfly Kallima inachus. Molecular Ecology Resources. 20(4): 1080–1092. (封面文章). (2019IF:6.286;5-IF:7.448)

3.Lu SH#, Yang J#, Dai XL#, Xie FA, He JW, Dong ZW, Mao JL, Liu GC, Chang Z, Zhao RP, Wan WT, Zhang R, Wang W*, Li XY*. 2019. Chromosomal-level reference genome of Chinese peacock butterfly (Papilio bianor) based on third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis. GigaScience. 8(11): giz128. (2019IF:5.993;5-IF:7.715)

4.Liu GC#, Chang Z#, Chen L#, He JW#, Dong ZW, Yang J, Lu SH, Zhao RP, Wan WT, Zhang R, Wang W*, Li XY*. 2020. Genome size variation in butterflies (Insecta, Lepidoptera, Papilionoidea): A thorough phylogenetic comparison. Systematic Entomology. 45(3): 571–582. (2019IF:3.909;5-IF:4.037)

5.Chen X#, Dong ZW#, Liu GC#, He JW, Zhao RP, Wang W*, Pen YQ*, Li XY*. 2019. Phylogenetic analysis provides insights into the evolution of Asian fireflies and adult bioluminescence. Molecular Phylogenetics and Evolution 140: 106600. (2019IF:3.496;5-IF:3.883)

6.Zhang R#, He JW#, Dong ZWA#, Liu GC#, Yin Y#, Zhang XY#, Li Q#, Ren YD, Yang YZ, Liu W, Chen XQ, Xia WH, Duan K, Hao F, Lin ZS, Yang J, Chang Z, Zhao RP, Wan WT, Lu SH, Peng YQ, Ge SQ*, Wang W*, Li XY*. 2020. Genomic and experimental data provide new insights into luciferin biosynthesis and bioluminescence evolution in fireflies. Scientifc Reports. 10(1):15882. (2019IF:3.998;5-IF:3.788)

7.He JW#, Liu GC#, Dong PX#, Dong ZW, Zhao RP, Wang W*, Li XY*. Molecular cloning, characterization, and evolution analysis of the luciferase genes from three sympatric sibling fireflies (Lampyridae: Lampyrinae, Diaphanes). Photochemical & Photobiological Sciences. https://doi.org/10.1007/s43630-021-00080-4 (2020IF: 3.982;2020-5-IF: 3.547)

8.Wan WT, Dong ZW, Ren YD, Yang J, Pan XY, He JW, Chang Z, Liu W, Liu GC, Zhao RP, Hu P, Mao CY, Li J, Wang W*, Li XY*. Chromatin accessibility profiling provides insights into larval cuticle color and adult longevity in butterflies. Zoological Research. 2021, 42(5): 614–619. (2020IF: 4.561;5-IF: NA )

9.常洲,董志巍,李学燕. 2021.彩云之南,蝴蝶王国.大自然(China Nature). (3): 04–08.

10.董志巍,常洲,李学燕. 2021.百花深处蝶飞舞.大自然(China Nature). (3): 48–53.

11.Dong ZW#, Li J#, He JW#, Liu GC, Mao CY, Zhao RP, Li XY*. 2021.The mitochondrial genome of a leaf insect Phyllium westwoodii (Phasmatodea: Phylliidae) in Southeast Asia. Mitochondrial DNA Part B:Resources. 6(3): 888–890.

12.Dong ZW#, Yiu Y#, Liu GC, He JW, Peng YQ, Zhao RP, Li XY*. 2021. Three new species of Lamprigera Motschulsky (Coleoptera, Lampyridae) from China, with notes on known species. Zootaxa. 4950 (3):441–468.

13.Liu GC#, Liu W#, Zhao RP#, He JW#, Dong ZW, Chen L, Wan WT, Chang Z, Wang W*, Li XY*. 2021. Genome-wide identification and gene-editing of pigment transporter genes in the swallowtail butterfly Papilio xuthus. BMC Genomics. 22: 120. (2019IF:3.594;5-IF:4.093)

14.Zhang R#, Li J#, Mao CY, Dong ZW, He JW, Liu GC, Zhao RP, Wang W*, Li XY*. 2021.The mitochondrial genome of one “twisted-wing parasite” Xenos cf. moutoni (Insecta, Strepsiptera, Xenidae) from Gaoligong Mountains, Southwest of China. Mitochondrial DNA Part B:Resources. 6(2): 512–514. (2019IF:0.885;5-IF:0.845)

15.Kusy D#, He JW#, Bybee S, MichaI M, Bi WX, Li XY*, Bocak L*. 2020. Phylogenomic relationships of bioluminescent elateroids define the “lampyroid clade” with clicking Sinopyrophoridae as its earliest member. Systematic Entomology. (2019IF:3.909;5-IF:4.037)

16.Liu GC#, Dong ZW#, Hou QB#, He JW, Zhao RP, Wang W, Li XY*. 2020. Second rhagophthalmid luciferase cloned from Chinese glow-worm Menghuoius giganteus (Rhagophthalmidae: Elateroidea). Photochemistry and Photobiology. 96(1): 46–54. (2019IF:2.721;5-IF:2.275)

17. Martin GJ*, Stanger-Hall KF, Branham MA, Da Silveira LFL, Lower SE, Hall DW, Li XY, Lemmon AR, Lemmon EM, Bybee SM. 2019. Higher-Level Phylogeny and Reclassification of Lampyridae (Coleoptera: Elateroidea). Insect Systematics and Diversity. 3(6): 11 (1–15).

18.Liu GC#, Zhang R#, Hou QB, He JW, Dong ZW, Zhao RP, Wang W*, Li XY*. 2019. Cloning and characterization of luciferase from the Chinese firefly Lamprigera yunnana. Photochemistry and Photobiology. 95(5):1186–1194. (2019IF:2.721;5-IF:2.275)

19.Bi WX#, He JW#, Chen CC, Kundrata R, Li XY*. 2019. Sinopyrophorinae, a new subfamily of Elateridae (Coleoptera, Elateroidea) with the first record of a luminous click beetle in Asia and evidence for multiple origins of bioluminescence in Elateridae. ZooKeys. (864): 79–97. (2019IF:1.137;5-IF:1.155)

20.He JW#, Bi WX#, Dong ZW, Liu GC, Zhao RP, Wang W*, Li XY*. 2019. The mitochondrial genome of the first luminous click-beetle (Coleoptera: Elateridae) recorded in Asia. Mitochondrial DNA Part B-Resources. 4(1): 565–567. (2019IF:0.885;5-IF:0.845)

21.Liu GC, Dong ZW, He JW, Zhao RP, Wang W, Li XY*. 2017. Genome size of 14 species of fireflies (Insecta, Coleoptera, Lampyridae). Zoological Research. 38(6): 449–458. (SCI-E)

22.Li XY#, Liu GC#, Sheng WJ#, Dong ZW, Chen L, Zhao RP, Wang W*. 2017. Genome editing in the butterfly type-species Papilio machaon. Insect Science. 24(4): 708–711. (2017, IF=2.026, 5year-IF=2.129)

23.李学燕*,董志巍. 2015. 森林里有一道绿光-走近萤火虫.人与自然. 161(7):90-101

24.Li XY, Nakajima Y, Niwa K, Viviani VR, Ohmiya Y*. 2010. Enhanced red-emitting railroad worm luciferase for bioassays and bioimaging. Protein Sciences. 19(1): 26–33. (2010, IF= 2.798, 5year-IF= 3.018)

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37.李学燕,梁醒财. 2006. 发光甲虫与生物荧光. 昆虫知识. 43(5): 736–741.

  研究团队

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