博士，研究员，中国科学院院士，发展中国家科学院院士，欧洲科学院院士。中国人与生物圈国家委员会主席、遗传进化与动物模型国家重点实验室学术委员会主任；国际重要刊物 Hum Mol Genet 、Natl Sci Rev、Zool Res、 Integr Zool编委。

建立我国第一个野生动物种质资源库，任我国生命领域首个大科学设施——中国西南野生生物种质资源库动物种质资源库主任。通过推动西南家猪分子育种与转化医学研究基地的建设，为国家生猪种业与大动物医学模型研究与转化应用提供平台支持及源头创新的育种新材料和疾病模型创制。

利用保藏的资源，主要从分子水平研究生物多样性的演化及机制，澄清了灵长类、食肉类、两栖爬行类等动物类群系统与演化中的一些重要问题。揭示了东亚人群进化的一些规律和一些民族的演化历程。系统地研究了野生动物和家养动物的遗传多样性，发现遗传多样性贫乏与物种濒危之间没有必然的对应关系；确定了家犬的东亚起源，证明东亚是家养动物驯化的重要区域。对自然选择和人工选择作用下基因组进化的研究，揭示了一些重要的动物适应进化和畜禽经济性状形成的遗传机制。在Science、Nature、Nature Genetics、PNAS等国际刊物发表SCI论文500余篇，专著1部。由于在生物多样性研究领域的突出贡献，获生物多样性领导奖（亚洲首位获奖人）、何梁何利基金科学与技术进步奖、国家自然科学二等奖（2006和2014）等奖项。联合发起国际生命条形码计划（iBOL）并使中国成为全球四个节点之一，牵头组织了世界两栖爬行类DNA条形码计划（Cold Code）、家犬基因组研究国际联盟（Dog10K）等大型国际合作，代表中国参加万种脊椎动物基因组计划（Genome 10K），产生了广泛的国际影响。

2022年当选国际生物地理学会首批杰出学者（Distinguished Fellow）

2022年度生物学科领域中国科学家排名第8（全球学者库）

2024年度遗传学领域中国科学家排名第9（Research.com网站）

经历

1982-1986    复旦大学生物系，学士

1986-1991    中国科学院昆明动物研究所，博士

1991-1992    中国科学院昆明动物研究所，助理研究员

1992-1995    美国圣地亚哥濒危动物繁殖中心（CRES）分子遗传实验室，博士后

1995-2000    中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室主任，研究员

1996-2005    中国科学院昆明动物研究所副所长

2005-2012.4  中国科学院昆明动物研究所所长

2003-至今    中国科学院院士  云南大学特聘教授

2007.11-至今  发展中国家科学院院士

2008-2016    遗传资源与进化国家重点实验室主任

2012.01-2024 中国科学院副院长

2018-至今    欧洲科学院院士

1.国家自然科学基金“动物重要特殊性状的进化创新和进化重塑”2024.01-2028.12

2.科技部2030脑计划重大项目“社交障碍的神经环路机制与干预研究”2021.12-2026.11

3.昆明市春城计划高层次创新创业团队项目“动物模型与转化医学应用”2022.06-2027.05

4.云南省重点研发计划项目“分子检测和基因编辑技术的研发与应用”2022.01-2024.12

5.科技部重点研发计划任务“生猪高产优质高效性状形成的分子调控网络” 2021.12-2026.11

6.中科院A类先导专项子课题“猪高产优质性状的分子基础”2019.11-2024.10

7.科技部青藏高原二次科考课题“青藏高原特有家养动物种质资源调查、挖掘与利用”、“国家青藏高原动物资源共享平台建设”2019.11-2024.10

8.中科院A类先导专项子课题“驯化动植物对高寒环境的适应及基因资源利用” 2018.03-2023.02

发表论文总数: 500余篇(*通讯作者)

近5年内发表的代表性论文/专著

1.Wang MS^#, Thakur M^#, Peng MS^#, Jiang Y^#, Frantz LAF^#, Li M, Zhang JJ, Wang S, Peters J, Otecko NO, Suwannapoom C, Guo X, Zheng ZQ, Esmailizadeh A, Hirimuthugoda NY, Ashari H, Suladari S, Zein MSA, Kusza S, Sohrabi S, Kharrati-Koopaee H, Shen QK, Zeng L, Yang MM, Wu YJ, Yang XY, Lu XM, Jia XZ, Nie QH, Lamont SJ, Lasagna E, Ceccobelli S, Gunwardana HGTN, Senasige TM, Feng SH, Si JF, Zhang H, Jin JQ, Li ML, Liu YH, Chen HM, Ma C, Dai SS, Bhuiyan AFH, Khan MS, Silva GLLP, Le TT, Mwai OA, Ibrahim MNM, Supple M, Shapiro B, Hanotte O, Zhang GJ, Larson G, Han JL^*, Wu DD^*, Zhang YP^*. 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Research, 2020, 38: 693-701. 

2.Xie HB^#*, Wang LG^#, Fan CY^#, Zhang LC^#, Adeola CA, Yin X, Zeng ZB^*, Wang LX^*, Zhang YP^*. Genetic architecture underlying nascent speciation of Eurasian domestic pigs. Molecular Biology and Evolution, 2020, 38:3556-3566 

3.Xie HB^#, Yan C^#, Adeola A.C.^#, Wang K^#, Huang CP^#, Xu MM, Qiu Q, Yin X, Fan CY, Ma YF, Yin TT, Gao Y, Deng JK, Okeyoyin A.O., Oluwole O.O., Omotosho O,M.O. Okoro M.O.V, Omitogun G.O., Dawuda P.M., Olaogun S.C., Nneji L.M., Ayoola A.O., Sanke O.J., Luka P.D., Okoth E, Lekolool I, Mijele D, Bishop R.P., Han JL^*, Wang W^*, Peng MS^*, Zhang YP^*.African Suid Genomes Provide Insights into the Local Adaptation to Diverse African Environments. Molecular Biology and Evolution, 2022, 39(12):msac256. 

4.Dai SS^#, Sulaiman X^#, Isakova J^#, Xu WF^#, Abdulloevich NT, Afanasevna ME, Ibrohimovich KB, Chen X, Yang WK, Wang MS, Shen QK, Yang XY, Yao YG, Aldashev AA, Saidov A, Chen W, Cheng LF*, Peng MS*,Zhang YP*. The genetic echo of the Tarim mummies in modern Central Asians.Molecular Biology and Evolution, 2022,39(9):msac179. 

5.He Y^#, Zhang X^#, Peng MS^#, Li YC^#, Liu K^#, Zhang Y, Mao L, Guo Y, Ma Y, Zhou B, Zheng W, Yue T, Liao Y, Liang SA, Chen L, Zhang W, Chen X, Tang B, Yang X, Ye K, Gao S, Lu Y, Wang Y, Wan S, Hao R, Wang X, Mao Y, Dai S, Gao Z, Yang LQ, Guo J, Li J, Liu C, Wang J, Sovannary T, Bunnath L, Kampuansai J, Inta A, Srikummool M, Kutanan W, Ho HQ, Pham KD, Singthong S, Sochampa S, Kyaing UW, Pongamornkul W, Morlaeku C, Rattanakrajangsri K; Consortium of Anthropological Research in Southeast Asia and Southwest China (CASEAC); Kong QP*, Zhang YP*, Su B*. Genome diversity and signatures of natural selection in mainland Southeast Asia. Nature, 2025 May 14.

其他代表性论文/专著

1.Ryder OA, McLaren A, Brenner S, Zhang YP, Benirschke K. Ecology - DNA banks for endangered animal species. Science, 2000, 288:275-277.

2.Murphy WJ, Eizirik E, Johnson WE, Zhang YP, Ryder OA, O'Brien SJ. Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals. Nature, 2001, 409:614-618.

3.Zhang JZ, Zhang YP, Rosenberg HF. Adaptive evolution of a duplicated pancreatic ribonuclease gene in a leaf-eating monkey. Nature Genetics, 2002, 30:411-415.

4.Savolainen P, Zhang YP, Luo J, Lundeberg J, Leitner T. Genetic evidence for an East Asian origin of domestic dogs. Science, 2002, 298:1610-1613.

5.Wang GD^#, Zhai WW^#, Yang HC^#, Wang L^#, Zhong L, Liu YH, Fan RX, Yin TT, Zhu CL, Poyarkov AD, Irwin DM, Hytonen MK, Lohi H, Wu CI, Savolainen P^*, Zhang YP^*. Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world. Cell Research, 2016, 26:21-33.