方向一

鳞翅翅目表型特征多样性演化。以蝴蝶和蛾类为例，整合多层次组学数据和实验数据，探讨翅膀等表型特征多样性的演化的遗传基础及仿生意义。

方向二

发光甲虫多样性演化及生物荧光演化。以发光甲虫为例，整合多层次组学数据和实验数据，开展分类和系统发育、生物荧光的起源与演化研究，挖掘生物荧光体系的应用。

方向三

其他特质昆虫重要性状演化。依托于云南丰富的昆虫资源，利用本实验室已搭建的现代昆虫学研究平台，挖掘其他特质昆虫，探讨其重要演性状的遗传基础及应用。

1.2004年“新世纪百千万人才工程国家级首批入选者”

2.2008年获“中国科学院百人计划”、“中科院王宽诚西部学者杰出贡献奖”以及“谈家桢生命科学创新奖”

3.2010年获“云南省自然科学一等奖”（第一完成人）

4.2012年获“国家自然科学二等奖”（第一完成人）

5.2017年获得两项“云南省自然科学二等奖”（分别为第一完成人和第二完成人）。

6.2019年获得 “云南省自然科学一等奖”（第三完成人）

7.2022年获“教育部自然科学一等奖”（第一完成人）以及“全国创新争优奖”

8.2023年获“国家自然科学二等奖”（第一完成人）

1.2004年-2006年，国家自然科学基金杰出青年基金

2.2004年-现在，主持国家自然科学基金重点项目6项

3.2007年-2011年，2012年-2017年，973前沿交叉项目首席科学家

4.2013年-2019年，国家基金委创新群体项目负责人

5.2014年-2019年，一项中科院战略性先导专项（B）两个首席科学家之一

6.2022年获首批“新基石研究员”项目支持

近5年内发表的代表性论文/专著

1.Li ZH^#, Xu ZY^#, Zhu L^#, Qin T^#, Ma JR^#, Feng ZY^#, Yue HS, Guan Q, Zhou BT, Han G, Zhang GK, Li CY, Jia SJ, Qiu Q*, Hao DJ*, Wang Y*, Wang W*.2025. High-quality sika deer omics data and integrative analysis reveal genic and cellular regulation of antler regeneration. Genome Research. 35(1):188-201. doi: 10.1101/gr.279448.124.

2. Zhou BT^#, Hu P^#, Liu GC^#, Chang Z, Dong ZW, Li ZH, Yin Y, Tian ZZ, Han G, Wang W*, Li XY*. 2024. Evolutionary patterns and functional effects of 3D chromatin structures in butterflies with intensive genome rearrangements. Nature Communications. 15(1):6303. doi: 10.1038/s41467-024-50529-0

3. Wang K^#, Wang J^#, Zhu CL^#, Yang LD^#, Ren YD^#, Ruan J^#, Fan GY^#, Hu J^#, Xu WJ, Bi XP, Zhu YA, Song Y, Chen HT, Ma TT, Zhao RP, Jiang HF, Zhang B, Feng CG, Yuan Y, Gan XL, Li YX, Zeng HH, Liu Q, Zhang YL, Shao F, Hao SJ, Zhang H, Xu X, Liu X, Wang DP, Zhu M, Zhang GJ, Zhao WM*, Qiu Q*, He SP*, Wang W*. 2021. African lungfish genome sheds light on the vertebrate water-to-land transition. Cell. 184(5):1362–1376. (Resource) (DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.047) (2021, IF=66.85, 5-Year IF=59.901)

4. Bi XP^#, Wang K^#, Yang LD^#, Pan HL^#, Jiang HF^#, Wei QW^#, Fang MQ, Yu H, Zhu CL, Cai YR, He YM, Gan XL, Zeng HH, Yu DQ, Zhu YA, Jiang HF, Qiu Q, Yang HM, Zhang Y, Wang W*, Zhu M*, He SP*, Zhang GJ*. 2021.Tracing the genetic footprints of vertebrate landing in non-teleost ray-finned fishes. Cell. 184(5):1377–1391. (Resource) (DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.046) (2021, IF=66.85, 5-Year IF=59.901)

5. Yin Y^#, Fan HZ^#, Zhou BT^#, Hu YB^#, Fan GY^#, Wang JH^#, Zhou F^#, Nie WH^#, Zhang CZ, Liu L, Zhong ZY, Zhu WB, Liu GH, Lin ZS, Liu C, Zhou J, Huang GP, Li ZH, Yu JP, Zhang YL, Yang Y, Zhuo BZ, Zhang BW, Chang J, Qian HY, Peng YM, Chen XQ, Chen L, Li ZP, Zhou Q*, Wang W*, Wei FW*. 2021. Molecular mechanisms and topological consequences of drastic chromosomal rearrangements of muntjac deer. Nature Communications. 12(1):6858. (doi: 10.1038/s41467-021-27091-0.) (2021, IF=17.694, 5-Year IF=17.763)

其他代表性论文/专著

1. Chen L#, Qiu Q#, Jiang Y#, Wang K#, Lin ZS#, Li ZP#, Bibi F, Yang YZ, Wang JH, Nie WH, Su WT, Liu GC, Li QY, Fu WW, Pan XY, Liu C, Yang J, Zhang CZ, Yin Y, Wang Y, Zhao Y, Zhang C, Wang ZK, Qin YL, Liu W, Wang B, Ren YD, Zhang R, Zeng Y, da Fonseca RR, Wei B, Li R, Wan WT, Zhao RP, Zhu WB, Wang YT, Duan SC, Gao Y, Zhang YE, Chen CY, Hvilsom C, Epps CW, Chemnick LG, Dong Y, Mirarab S, Siegismund HR, Ryder OA, Gilbert MTP, Lewin HA, Zhang GJ*, Heller R*, Wang W*. 2019. Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits. Science. 364(6446). (doi: 10.1126/science.aav6202) (2019, IF= 41.845, 5-Year IF= 44.372)

2. Wang Y#, Zhang CZ#, Wang NN#, Li ZP#, Heller R#, Liu R#, Zhao Y#, Han JG#, Pan XY, Zheng ZQ, Dai XQ, Chen CS, Dou ML, Peng SJ, Chen XQ, Liu J, Li M, Wang K, Liu C, Lin ZS, Chen L, Hao F, Zhu WB, Song CC, Zhao C, Zheng CL, Wang GM, Hu SW, Li CY, Yang H, Jiang L, Li GY, Liu MJ, Sonstegard TS, Zhang GJ, Jiang Y*, Wang W*, Qiu Q*. 2019. Genetic basis of ruminant headgear and rapid antler regeneration. Science. 364(6446). (doi: 10.1126/science.aav6335) (2019, IF= 41.845, 5-Year IF= 44.372).

3 .Li XY#, Fan DD#, Zhang W#, Liu GC#, Zhang L#, Zhao L, Fang X, Chen L, Dong Y, Chen Y, Ding Y, Zhao RP, Feng MJ, Zhu Y, Feng Y, Jiang XT, Zhu DY, Xiang H, Feng XK, Li SC, Wang J*, Zhang GJ*, Kronforst MR* & Wang W*. 2015. Outbred genome sequencing and CRISPR/Cas9 gene editing in butterflies. Nature Communications. 6: 8212.（Nat Commun. 2015 Sep10; 6:8212. doi:10. 1038/ncomms9212. (2015, IF= 11.47, 5-Year IF= 11.904)

4.Wang W, Yu HJ, Long MY*. 2004. Duplication-degeneration as a mechanism of gene fission and the origin of Drosophila new genes. Nature Genetics. 36: 523-527. (2004, IF= 24.695).

5. Long MY, Betran E, Kevin T, Wang W*. 2003. Origin of new genes: glimpses from the young and old. Nature Reviews Genetics. 4: 856-875. (2003, IF= 25.664).