中国科学院昆明动物研究所（以下简称昆明动物所）直属于中国科学院，是我国生物多样性演化、保护与可持续利用领域的综合性研究机构。昆明动物所成立于1959年4月，其前身为昆虫研究所紫胶站，1963年改名为中国科学院西南动物研究所，1970年划归云南省后改名为云南省动物研究所，1978年重归中国科学院，恢复原所名。 

　　2016年，昆明动物所完成“十三五”战略规划编制工作，确立了“一体两翼”跨越发展战略构想：“一体”即研究所“十三五”期间的“一三五”布局，“两翼”分别是“动物遗传与进化前沿交叉卓越研究中心”建设和“模式动物（灵长类）表型与遗传研究设施”。稳步推进“动物复杂性状的进化解析与调控”先导专项工作，顺利完成院规划局组织的国际评估和中期评议。依托先导专项，积极推进“中国科学院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心”建设，力争建成具有学科高地性质的科学研究中心。重点部署“模式动物表型与遗传研究设施（灵长类）”国家重大科技基础设施建设，项目建议书获国家发改委批复，计划投资3.6648亿元，建设周期5年。目前已完成项目可行性研究报告的编制，各项工作正稳步推进。同时，研究所作为建设依托单位的“西南生物多样性实验室”顺利通过云南省发改委和院条件保障与财务局组织的竣工验收。 

　　昆明动物所现有研究团队36个，拥有遗传资源与进化国家重点实验室、中国科学院-云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室、云南省“动物生殖生物学重点实验室”、“畜禽分子生物学重点实验室”和“活性多肽研究与利用重点实验室（培育）”，与香港中文大学联合共建“生物资源与疾病分子机理联合实验室”，与苏州大学联合共建“疾病动物模型与新药研发联合实验室”，与中国科技大学联合共建“天然活性多肽联合实验室”。建设有非法人研究单元“灵长类研究中心”、“中国科学院非人灵长类种子中心”等10个支撑机构与技术平台，以及“无量山黑冠长臂猿监测站”和“昭通大山包野生动物野外观测站”2个野外台站。 

　　中国科学院与云南省合作共建的昆明动物博物馆，馆藏各类动物标本80万余号，是我国热带、亚热带动物种类、数量收藏最多的标本馆。图书馆有中、外文科技藏书3.8万册，中外文科技期刊16万余册。200万以上大型仪器装备总值5000余万元。 

　　截至2016年底，昆明动物所共有在职职工413人。其中科技人员175人、科技支撑人员197人，包括中国科学院院士1人、发展中国家科学院院士1人、研究员及正高级工程技术人员34人、副研究员及高级工程技术、高级实验技术人员55人。 

　　共有国家杰出青年科学基金获得者10人。国家优秀青年科学基金获得者4人（新增1人）；享受国务院颁发政府特殊津贴人员12人；科技部中青年科技创新领军人才4人；中科院青年创新促进会会员17人（新增3人），优秀会员2人（新增1人）；“西部之光”人才入选者115人（新增8人）。 

　　昆明动物所是1980年国务院学位委员会批准的博士、硕士学位授予权单位之一，现设有动物学、神经生物学、遗传学、细胞生物学4个专业二级学科博士研究生培养点，动物学、神经生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生物工程6个专业二级学科硕士研究生培养点和基础医学专业一级学科硕士研究生培养点，并设有生物学专业一级学科博士后流动站，共有在学研究生354人（其中硕士生183人、博士生171人）、在站博士后25人。 

　　2016年，昆明动物所共有在研项目554项（新增113项）。其中，主持国家重点基础研究发展计划（973）项目2项、主持课题8项，参与重点研发计划课题7项（新增7项）；主持国家自然科学基金创新群体1项，国家杰出青年科学基金项目3项，国家优秀青年科学基金项目4项（新增1项）， NSFC-云南省联合基金重点项目10项（新增3项），重大研究计划7项（新增1项），国际合作与交流项目4项（新增3项），重点项目1项，面上项目68项（新增14项），青年项目48项（新增13项）；主持中国科学院战略性先导科技专项1项、项目3项、课题17项（新增3项），院重点部署项目3项（新增3项）。 

　　2016年，昆明动物所在多个研究方向均取得了重要进展。在动物复杂性状的进化机制方向，揭示了金丝猴高原适应、家鸡视觉退化的遗传机制和金线鲃洞穴生活、翻车鱼快速生长的基因组进化奥秘，发现了高原哺乳动物瘤胃微生物组的趋同进化。在动物多样性方向，揭示了家犬扩散的迁徙路线，构建了蛙属物种的系统演化历史，发现鼩鼹类是一个单系群，证实近代物种加速消亡与人类活动有关。在人类进化方向，阐明了东亚人群肤色变浅的进化遗传机制和灵长类大脑起源进化过程中的表观遗传变化，发现低氧可能诱导藏族人群长寿。在疾病机理解析方向，证实BDNF在欧洲人群中与双相情感障碍相关并揭示了银屑病的分子机制。在动物模型方向，揭示了树鼩缺失免疫基因RIG-I的机制，利用树鼩精原干细胞获得世界首只转基因树鼩。上述研究成果发表于Nature Genetics等国际一流期刊。 

　　2016年，发表SCI论文249篇，包括发表在Nature Genetics、Nature Communications等五年影响因子（IF）> 9的国际著名期刊论文29篇。申请专利（已获得申请号的专利）28项，其中包括24项发明专利和4项实用新型专利，授权专利16项，包括14项发明专利和2项实用新型专利。登记软件著作权1项。 

　　2016年，昆明动物所共派出103人次出访17个国家和地区进行交流合作。接待国外来访学者83人次。在研的国际合作项目7项，新获中国科学院国际人才交流计划6项，延期资助2项。推进实施国际生命条形码和“国际两栖爬行类生命条形码计划（Cold Code）”，发起“千犬基因组计划”，积极参与“中非中心”、“东南亚中心”、“中斯中心”和“中亚生态与环境研究中心”的建设和国际合作项目的开展。 

　　昆明动物所是云南省动物学会、云南省细胞与生物学会、云南省免疫学会、云南省实验动物学会的挂靠单位，负责编辑出版动物学核心刊物《动物学研究》，该刊物入选“2016中国国际影响力学术期刊”，获得“2016-2018中国科技期刊国际影响力提升计划”B类资助。