主要从事灵长类大脑演化的遗传学机制、东亚现代人起源、迁徙以及对环境因素的适应性进化研究;采用比较基因组和功能基因组学手段解析人类起源与进化的遗传基础。
1.灵长类大脑功能演化的基因组与遗传学基础人类区别于非人灵长类最为显著的特征是人类发达的大脑。大脑容量急剧增加和认知能力的巨大飞跃是人类起源的关键所在。然而,导致人类这一根本性变化的遗传学机制尚不清楚。宿兵研究员课题组的主要研究方向为灵长类大脑功能演化的基因组与遗传学基础研究,主要采用比较基因组学、生物信息学与功能实验相结合的研究方法,通过系统研究在灵长类中枢神经系统中发挥重要生物学功能的基因、基因家族和染色体区域在基因序列、选择性剪接、非编码RNA表达调控、基因表达谱、DNA甲基化谱等不同层次的变异模式,建立基因结构、基因表达与调控、表观遗传修饰等不同层次的分子进化模式同灵长类大脑功能演化的关系,确定在灵长类大脑功能演化过程中起关键作用的基因和基因家族,尤其是在人类起源中对人类智力发挥重要作用的基因和基因家族,从而揭示灵长类大脑功能演化的基因组与遗传学基础,为诸如帕金森氏症(PD)、老年痴呆症(AD)等人类中枢神经系统退行性疾病的发病机理和早期预防与治疗提供基础数据。
2.东亚现代人的起源、迁徙与适应性进化
灵长类大脑功能演化与人类的起源与迁徙是两个密切相关的研究课题,人类从非洲起源以后在向其它地区扩散的过程中仍然发生着对温度、太阳紫外线辐射、高原缺氧等环境因素以及食物结构改变、疾病等各种因素的适应性进化。东亚地区幅员辽阔、人口密集、南北纬度跨度大,是研究人类群体遗传多样性和适应性进化最重要的地区之一。(1)通过系统分析人类mtDNA和Y-染色体DNA、以及化石和遗骸古DNA的遗传变异在东亚地区人群中的分布模式,探索东亚现代人起源的方式,重建其史前迁徙的路线,了解人类群体遗传结构的历史变迁及其与人群文化和语言分化的关系。(2)通过系统分析诸如温度、太阳紫外线辐射、高原缺氧等环境因素指标与人群基因组变异之间的相关性,探讨人群在史前迁徙过程中对环境、饮食等各类因素的适应性进化的遗传学机制,为癌症等人类重大疾病的流行病学研究提供重要信息。
1) Peng Y,…,Su B*Down-regulation of EPAS1 and genetic adaptation of Tibetans to high altitude hypoxia.Molecular Biology and Evolution2017, 34(4):818-830.
2) Shi L, Lin Q,Su B*Human-Specific Hypomethylation of CENPJ, a Key Brain Size Regulator.Molecular Biology and Evolution2014, 31:594-604.
3) Li M,…,Su B*Allelic differences between Europeans and Chinese for CREB1 SNPs and their implications in gene expression regulation, hippocampal structure and function, and bipolar disorder susceptibility.Molecular Psychiatry2014, 19:452-461.
4) Zhang XM, Qi XB, Yang ZH, Serey B, Sovannary T, Bunnath L, Aun HS, Samnom H, Zhang H, Lin Q, van Oven M, Shi H,Su B*Analysis of mitochondrial genome diversity identifies new and ancient maternal lineages in Cambodian aborigines.Nature Communications2013, 4:2599.
5) Shi H,…,Su B*, Lu X Winter Temperature and UV are Tightly Linked to Genetic Changes in the p53 Tumor Suppressor Pathway in Eastern Asia.American Journal of Human Genetics2009, 84:534-541.
6) Zhang R, Peng Y, Wang W,Su B*.Rapid evolution of an X-linked microRNA cluster in primates.Genome Research2007, 17:612-617.
7) Shi H, Dong YL, Wen B, Xiao CJ, Underhill PA, Shen PD, Chakraborty R, Jin L andSu B*. 2005 Y chromosome evidence of southern origin of the East Asian specific haplogroup O3-M122.American Journal of Human Genetics2005, 77: 408-419.
8) Ke YH,Su B(co-first author). et al. No independent origin of modern humans in East Asia: a tale of 12,000 Y chromosomes.Science2001, 292:1151-1153.
9) Jin L andSu B. Natives or Immigrants: Modern human origin in East Asia.Nature Reviews Genetics1:126-133, 2000.
10)Su, Bet al. Y Chromosome evidence for a Northward Migration of Modern Humans into East Asia during the Last Ice Age. American Journal of Human Genetics1999, 65:1718-1724.
|