徐书华
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徐书华,1978.02.10,博士,研究员,所长助理
个人简历    

学习经历 

2003/092006/07    复旦大学生命科学学院 博士研究生  

1996/092003/07    湖北大学生命科学学院 学士、硕士   

科研与学术工作经历: 

2012/01—至今中科院上海生科院计算生物学研究所马普青年科学家小组组长 

2010/12—至今中科院上海生科院计算生物学研究所研究员、博士生导师 

2009/12—至今中科院上海生科院计算生物学研究所研究组长(PI) 

2008/122009/11 中科院上海生科院计算生物学研究所  副研究员 

2006/072008/11 中科院上海生科院计算生物学研究所  助理研究员 

承担科研项目 :

[1]  国家自然科学基金—重大研究计划—集成项目(批准号:91731303);不同时期遗传混合对东亚、东南亚等地区人群基因多样性的影响及其适应机制;2018.1-2019.12负责人(在研)。 

[2]  国家杰出青年基金(批准号:31525014);基因交流与重组对人群复杂性状形成及环境适应的内在驱动;2016.1-2020.12负责人(在研)。 

[3]  中科院前沿科学重点项目(批准号:QYZDJ-SSW-SYS009);人群混合驱动遗传负荷动态演化的机制研究;2016.1-2020.12;负责人(在研)。 

[4]  上海市优秀学术带头人(批准号:16DX1404700);欧亚混合人群拷贝数变异的进化基因组学研究;2016.5-2019.4;负责人(在研)。 

[5]  科技部国家重点研发计划(批准号:2016YFC0906403;建立精神分裂症个体化诊疗方案及开发相应的精准检测技术; 2016.7-2020.12负责人(在研)。 

[6]  中国科学院—先导专项B类——“动物复杂性状的进化解析与调控项目四:复杂性状形成与演化的进化驱动力(批准号:XDB13040100);2014.7-2019.6负责人(在研)。 

[7]  国家自然科学基金—重点项目批准号:91331204);基因交流与重组对人群复杂性状形成及环境适应的内在驱动;2014.1-2017.12负责人(已结题)。 

[8]  国家自然科学基金—面上项目批准号:31171218);建立基于混合人群的基因相互作用研究策略:新疆典型混合人群的全基因组研究;2012.1-2015.12负责人(已结题)。 

[9]  国家自然科学基金—面上项目批准号:30971577);利用单核苷酸多态性和拷贝数变异构建中国混合人群的基因定位图谱;2010.1-2012.12负责人(已结题)。 

 

学术任职: 

2018/11 -至今,中国遗传学会,理事 

2018/11 -至今,中国妇幼保健协会精准医学专业委员会,常务委员 

2018/09 -至今,《生命科学》,编委 

2018/04 -至今,深圳华大生命科学研究院,高级科学顾问 

2018/01 -至今,《精准医学杂志》,编委 

2017/12 -至今,复旦大学教育部重点实验室学术委员会,委员 

2015/11 -至今,上海市遗传学会,常务理事 

2015/10 -至今,《Hereditas(英国)(SCI收录),编委 

2014/07-至今,《BMC Genetics(英国)(SCI收录),编委(Section Editor 

2014/01 -至今,《Human Genomics(英国)(SCI收录),编委 

2014/01 -至今,《Scientific Reports(英国)(SCI收录),编委 

2013/01 -至今,《Molecular Genetics and Genomics(德国)(SCI收录),编委 

2013- 2018中国遗传学会青年委员会,委员 

2012/10 -至今,上海科技大学,特聘教授 

2012/08-至今,上海市人类学会,理事 

2012/05-至今,宁夏医科大学,客座教授 

2011/08-至今,上海市遗传学会,理事 

2011/08-至今,《Frontier in Genetics(美国),评审编委 

2009- 2013马来亚大学计算信息生物学研究中心(CRYSTAL)学术顾问 

获奖及荣誉称号: 

科技部创新人才推进计划2018 

教育部自然科学奖(一等)(第5完成人)(2018 

上海市优秀学术带头人(2016 

中国科学院特聘研究员” --特聘核心骨干(2015 

中国科学院青年创新促进会(首届)“优秀会员”(2015 

获得“国家杰出青年科学基金”2015 

国家自然科学二等奖(第2完成人)(2015 

上海市第六届青年科技英才提名奖(2012.11 

中科院青年科学家奖(2012 

中科院上海生科院-美国礼来公司优秀毕业论文导师奖(2012.05 

中科院上海分院第三届杰出青年科技人才奖(2012 

教育部自然科学一等奖(第2完成人)(2012 

上海市科技启明星(2011 

全国百篇优秀博士学位论文(2011 

入选首届中国科学院青年创新促进会(2011 

复旦大学优秀博士学位论文(2010 

上海市优秀博士学位论文(2009 

法国赛诺菲-安万特-上海生科院青年人才奖(2009 

日本明治乳业生命科学奖(2009 

中国科学院卢嘉锡青年人才奖(2009 

主要研究方向及内容   

长期致力于群体基因组学研究,专注于遗传和微观进化问题;发展和运用群体基因组学方法和计算生物学手段研究人群的遗传结构、环境适应和微观进化机制。  

代表性论文    

   [1]     Zhang C #, Gao Y#, Liu J, Xue Z, Lu Y, Deng L, Tian L, Feng Q,Xu S*.  PGG.Population: a database for understanding the genomic diversity and genetic ancestry of human populations. Nucleic Acids Research2017, doi:10.1093/nar/gkx1032. 

 

[2]     Zhang C#, Lu Y#, Feng Q#, Wang X#, Lou H, Liu J, Ning Z, Yuan K, Wang Y, Zhou Y, Deng L, Liu L, Yang Y, Li S, Ma L, Zhang Z, Jin L, Su B, Kang L and Xu S*. Differentiated demographic histories and local adaptations between Sherpas and Tibetans. Genome Biology2017,18:115. 

 

[3]     Feng Q#, Lu Y#, Ni X#, Yuan K#, Yang Y#, Yang X, Liu C, Lou H, Ning Z, Wang Y, Lu D, Zhang C, Zhou Y, Shi M, Tian L, Wang X, Zhang X, Li J, Khan A, Guan Y, Tang K*, Wang S*,Xu S*.  Genetic history of Xinjiang’s Uyghurs suggests Bronze Age multiple-way contacts in Eurasia. Molecular Biology and Evolution,2017,34(10):2572-2582. 

 

[4]     Lu D#, Lou H#, Yuan K#, Wang X#, Wang Y#, Zhang C#, Lu Y, Yang X, Deng L, Zhou Y, Feng Q, Hu Y, Ding Q, Yang Y, Li S, Jin L, Guan Y, Su B, Kang L, andXu S*. Ancestral Origins and Genetic History of Tibetan Highlanders. Am.J.Hum.Genet., 2016,99:580-594. 

 

[5]     Lou H#, Lu Y#, Lu D#, Fu R#, Wang X#, Feng Q, Wu S, Yang Y, Li S, Kang L, Guan Y, Hoh BP, Chung YJ, Jin L, Su B,Xu S*.A 3.4-kb Copy-Number Deletion nearEPAS1Is Significantly Enriched in High-Altitude Tibetans but Absent from the Denisovan Sequence.Am.J.Hum.Genet., 201597(1):54-66.

 

[6]     Jin W, Wang S, Wang H, Jin L,Xu S*.Exploring Population Admixture Dynamics Using Empirical and Simulated Genome-Wide Distribution of Ancestral Chromosomal Segments.American Journal of Human Genetics, 201291:849-862. 

 

[7]     Xu S*, Pugach I, Stoneking M, Kayser M, Jin L, The HUGO Pan-Asian SNP Consortium.Genetic Dating Indicates that the Asian-Papuan Admixture through Eastern Indonesia Corresponds to the Austronesian Expansion.Proceedings of the National Academy of Sciences, 2012109(12):4574-4579. 

 

[8]     Jin W,Xu S*, Wang H, Li Y, Shen Y, Wu B, Jin L*.Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture.Genome Research, 201222(3):519-527. 

 

[9]     Xu S*, Li S, Yang Y, Tan J, Lou H, Jin W, Yang L, Pan X, Wang J, Shen Y, Wu B, Wang H, Jin L*. A Genome-Wide Search for Signals of High Altitude Adaptation in Tibetans.Molecular Biology and Evolution, 201128:1003-1011. 

 

[10] The HUGO Pan-Asian SNP Consortium (Jin L*, Liu ET*, Seielstad M*,Xu S*; 93 authors from 10 countries).Mapping Genetic Diversity in Asia.Science, 2009326:1541-1545. 

 

 

 

 

 

 

 

 

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