学术经历
2002年毕业于中国科学技术大学生物专业，获理学学士学位；2004年毕业于美国康奈尔大学生物统计与计算生物学专业，获理学硕士学位；2008年毕业于美国加州大学伯克利分校整合生物系获博士学位；2009年2月-2009年6月加州大学伯克利分校整合生物系做博士后研究。
科研与学术工作经历
2009年6月-2013年8月中国科学院北京基因组研究所副研究员。
2013年9月-2018年6月新加坡基因组研究院研究员(PI)。
2016年12月-2018年6月新加坡国家癌症中心兼职教授。
2017年4月-2018年6月南洋理工大学生命科学学院兼职助理教授。
2018年7月-今中国科学院动物研究所研究员。
承担科研项目
1.．2011.1- 2013.12,基金委青年项目(NSFC, 31000957),主持，果蝇小片段插入和缺失的种群遗传和分子进化的研究
2．2012.1- 2014.12,基金委重大研究计划培育项目(NSFC, 91131011),主持，癌症细胞群体发展和增值模型的建立和数据采集
3．2012.1- 2013.12,科技部973项目(MOST, 2012CB316505),骨干，基于新一代测序数据的统计遗传学新理论、方法与应用
4．2011.1-2013.12,青年创新促进会, 2011-2013
5. 2018.08-2021.12,国家重点研发计划(2018YFC1406900):综合基因、地质和空间信息技术的南极企鹅物种演化和栖息地变迁研究,子课题
2017年 Sanofi-Cell Research 2016年度最佳论文奖，2012年青年创新促进会会员，中国科学院，2011年AAAS Newcomb Cleveland Prize (科学杂志年度最佳论文奖)。
1)适应性进化的方法学和应用
如何在大规模进化树上有效地检测适应性进化是在大数据时代一个很重要的科学问题。我们利用随机过程的马尔科夫过程，设计了一个从后验概率里随机取样的概率学模型。通过对不同密码子位点在不同的进化分支上的突变特征，我们设计多个统计量来刻画适应性进化的动态变化规律。利用上述模型，我们以大规模感冒病毒数据为例证，刻画了病毒在扩增过程中的特异性的适应性进化，并发现该适应性进化和病毒疫苗的有效性有着强烈的相关。该研究方向有效地结合了随机过程理论、统计学方法、病毒演化的生物学以及遗传流行病学的内容。
2)驯化物种的起源与进化
面向多个驯化的物种（例如家犬和水稻），我们专注于研究物种演化的起源历史以及适应性进化的研究。这样的研究对于理解物种适应的遗传学机制，东亚文明起源的历史背景有着重要的意义。
3)多细胞群体遗传学以及癌症演化
多细胞物种里的细胞是一个自然的群体。他们的演化是一个非常有意思的科学问题。 我们面向东亚的肺癌和肝癌，刻画了癌症的异质性和演化的规律。我们发现东亚的肺癌的异质性比欧洲人的肺癌异质性要高很多，这是人类癌症里少数的几个种族异质性的研究。随着单细胞技术的发展，这一研究方向的进展会推动新的研究方向的快速出现和推进（例如体细胞镶嵌，发育演化等一系列的研究方向）。
1.Nahar R#,Zhai W#, Zhang T#, Takano A, Khng AJ, Lee YY, Liu X, Lim CH, Koh TPT, Aung ZW, Lim TKH, Veeravalli L, Yuan J, Teo ASM, Chan CX, Poh HM, Chua IML, Liew AA, Lau DPX, Kwang XL, Toh CK, Lim WT, Lim B, Tam WL, Tan EH, Hillmer AM*, Tan DSW*. Elucidating the genomic architecture of Asian EGFR-mutant lung adenocarcinoma through multi-region exome sequencing.Nat Commun.2018 Jan 15;9(1):216. (Equal contribution)
2.Zhai W？,#,Lim TK#, Zhang T#, Phang ST, Tiang Z, Guan P, Ng MH, Lim JQ, Yao F, Li Z, Ng PY, Yan J, Goh BK, Chung AY, Choo SP, Khor CC, Soon WW, Sung KW, Foo RS？, Chow PK？, The spatial organization of intra-tumour heterogeneity and evolutionary trajectories of metastases in hepatocellular carcinoma,Nature Communications, 2017 Feb 27;8:4565 (IF 11.3, # Equal contribution)
3.Chen H, Deng Q, Ng SH, Lee RT, Maurer-Stroh S,Zhai W*., Dynamic convergent evolution drives the passage adaptation across 48 years’ history of H3N2 influenza evolutionMol Biol Evol. 2016 Dec;33(12):3133-3143 (IF 13.6)
4.Wang,G-D#,Zhai, W#, Yang, H-C#, Wang, L#, Zhong, L , Liu Y-H, Fan, R-X, Yin,T-T, Zhu, C-L, Poyarkov, AD, Irwin,DM, Hyt？nen,MK, Lohi, H, Wu,C-I, Savolainen,P, Zhang, Y-P, Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world,Cell Res,2016 Jan;26(1):21-33(# joint first author，cover story, IF 14.8).
5.Chong Z#,Zhai W#, Li C, Gao M, Gong Q, Ruan J, Li J, Jiang L, Lv X, Hungate E, Wu CI*. The Evolution of Small Insertions and Deletions in the Coding Genes of Drosophila melanogaster.Mol Biol Evol. 2013 Dec;30(12):2699-708. (# Equal contribution)
6.Wang GD#,Zhai W#, Yang HC, Fan RX, Cao X, Zhong L, Wang L, Liu F, Wu H, Cheng LG, Poyarkov AD, Poyarkov NA Jr, Tang SS, Zhao WM, Gao Y, Lv XM, Irwin DM, Savolainen P, Wu CI*, Zhang YP*.The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humansNat Commun. 2013;4:1860. (# Equal contribution)
7.Hu Z, Fu Y-X, Greenberg AJ, Wu C-I*,Zhai W*(2013) Age-Dependent Transition from Cell-Level to Population-Level Control in Murine Intestinal Homeostasis Revealed by Coalescence Analysis.PLoS Genet9(2): e1003326. (* co-corresponding author)
8.Zhai W, Nielsen R, Goldman N, Yang Z. Looking for darwin in genomic sequences--validity and success of statistical methods.Mol Biol Evol. 2012 Oct;29(10):2889-93.
9.Tao Y#, Ruan J#, Yeh SH#, Lu X#, Wang Y#,Zhai W#, Cai J#, et al Chen DS*, Chen PJ*, Wu CI*. Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data.Proc Natl Acad Sci U S A.2011 Jul 19;108(29):12042-7. (#Equal contribution)
10.He Z#,Zhai W#, Wen H#, Tang T, Wang Y, Lu X, Greenberg AJ, Hudson RR, Wu CI*, Shi S*. Two evolutionary histories in the genome of rice: the roles of domestication genes.PLoS Genet. 2011 Jun;7(6):e1002100. (# Equal contribution)
11.Green RE#, Krause J#, Briggs AW#, Maricic T#, Stenzel U#, Kircher M#, Patterson N#, Li H,Zhai W, et al, Reich D*, P？？bo S*. A draft sequence of the Neandertal genome.Science. 2010 May 7;328(5979):710-22. (10 breakthroughs of the year, AAAS Newcomb-Cleveland Prize, best paper of the year for Science, cover story)
12.Zhai W, Nielsen R, Slatkin M. An investigation of the statistical power of neutrality tests based on comparative and population genetic data.Mol Biol Evol.2009 Feb;26(2):273-83.
13.Zhai W, Slatkin M, Nielsen R.Exploring variation in the d(N)/d(S) ratio among sites and lineages using mutational mappings: applications to the influenza virus.J Mol Evol.2007 Sep;65(3):340-8.
14.Zhai W, Todd MJ, Nielsen R. Is haplotype block identification useful for association mapping studies?Genet Epidemiol.2004 Jul;27(1):80-3.
