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Philipp Khaitovich

Philipp Khaitovich博士，生于1973年11月，中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员，俄罗斯Skolkovo科学技术学院教授，上海科技大学教授，德国马普协会进化人类学研究所Fellow。

个人简介

1994年毕业于俄罗斯莫斯科国立大学分子生物学专业，获理学学士学位； 1994年9月至1995年6月在俄罗斯普希诺蛋白质研究所实习； 1999年毕业于美国伊利诺伊大学芝加哥分校分子生物学专业，获理学博士学位;1999年至2000年在美国伊利诺伊大学芝加哥分校做博士后研究；2000年至2003年在德国马普协会进化人类学研究所做博士后研究。2003年9月—2006年8月德国马普协会进化人类学研究所，项目组长。 2006年9月—2012年8月中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所，独立青年科学家小组组长，研究员。2012年9月2017年8月中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所，所长。2013年2月至今，上海科技大学，教授。2013年1月至今德国马普协会进化人类学研究所，Max Planck Society Fellow.2014年4月至今俄罗斯莫斯科Skolkovo科学与技术研究所研究员。2017年9月至今中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员兼职所长。他先后主持国家自然科学基金委面上项目、重大计划、科技部973项目、科技部国际合作项目和中科院国际合作项目等多项科研项目。主持的项目包括中国科学院战略性先导科技专项（B类），国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目，国家重点研发计划。现任PLoS Biology，BMC Genomics国际刊物编委，曾任eLife编委，并担任Nature，Science，eLife，PLoS Biology，PLoS Genetics，PLoS Computational Biology，Molecular Biology and Evolution等本领域多种国际刊物同行审稿人。曾获中国科学院青年科学家国际合作奖（2012），青年科学家国际合作奖（2012），入选2012年中组部“外专千人”计划，青年科学家国际合作奖（2013），2013年获上海市“白玉兰纪念奖”，国家“友谊奖”，2015年中俄国家“友谊奖”。

主要研究方向及内容

人类脑结构、功能复杂特性的进化分子机制

人类脑容量脑结构的变化是整个生物演化过程中最显著的特征之一，人脑功能和认知能力经历了从简单到复杂的发育过程，然而导致这种急剧变化的遗传机制尚不清楚。我们主要关注于人类特异基因表达的进化模式和寻找作用于人类特有表型特征的关键基因，揭示在人类进化历程中正选择的基因对人类潜在特殊能力，尤其是人类认知能力方面的作用机制。主要研究包括：（1）通过多组学整合，研究人脑从发育到衰老过程中的分子和调控机制；（2）通过比较人类和近缘灵长类动物脑部在发育衰老全过程中的转录组、代谢组、脂质组等多种分子水平的变化，鉴定人脑特有的分子变化特征并据此探索人脑特有功能的进化机制；（3）通过比较健康人脑和具有认知相关疾病人脑在多种组学上的差异，研究人脑发达认知能力形成的分子机制。通过构建人脑和灵长类大脑动态进化发育的高维图谱，将有助于对已有的神经生物学成果进行整合，进而对深入了解大脑的功能。

代表性论文

1. Li, Q., K. Bozek, C. Xu, Y. Guo, J. Sun, S. Paabo, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, Y. Li, L. Willmitzer, P. Giavalisco* and P. Khaitovich*. "Changes in Lipidome Composition During Brain Development in Humans, Chimpanzees, and Macaque Monkeys." Mol Biol Evol 34, no. 5 (2017): 1155-1166.

2. He, Z., D. Han, O. Efimova, P. Guijarro, Q. Yu, A. Oleksiak, S. Jiang, K. Anokhin, B. Velichkovsky, S. Grunewald and P. Khaitovich*. "Comprehensive Transcriptome Analysis of Neocortical Layers in Humans, Chimpanzees and Macaques." Nat Neurosci 20, no. 6 (2017): 886-895.

3. Liu, X., D. Han, M. Somel, X. Jiang, H. Hu, P. Guijarro, N. Zhang, A. Mitchell, T. Halene, J. J. Ely, C. C. Sherwood, P. R. Hof, Z. Qiu, S. Paabo*, S. Akbarian* and P. Khaitovich*. "Disruption of an Evolutionarily Novel Synaptic Expression Pattern in Autism." PLoS Biol 14, no. 9 (2016): e1002558.

4. Wei, Y. N., H. Y. Hu, G. C. Xie, N. Fu, Z. B. Ning, R. Zeng* and P. Khaitovich*. "Transcript and Protein Expression Decoupling Reveals Rna Binding Proteins and Mirnas as Potential Modulators of Human Aging." Genome Biol 16, (2015): 41.

5. Bozek, K., Y. Wei, Z. Yan, X. Liu, J. Xiong, M. Sugimoto, M. Tomita, S. Paabo, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, Y. Li, D. Steinhauser, L. Willmitzer, P. Giavalisco* and P. Khaitovich*. "Organization and Evolution of Brain Lipidome Revealed by Large-Scale Analysis of Human, Chimpanzee, Macaque, and Mouse Tissues." Neuron 85, no. 4 (2015): 695-702.

6. Khrameeva, E. E., K. Bozek, L. He, Z. Yan, X. Jiang, Y. Wei, K. Tang, M. S. Gelfand, K. Prufer, J. Kelso, S. Paabo, P. Giavalisco*, M. Lachmann* and P. Khaitovich*. "Neanderthal Ancestry Drives Evolution of Lipid Catabolism in Contemporary Europeans." Nat Commun 5, (2014): 3584.

7. Bozek, K., Y. Wei, Z. Yan, X. Liu, J. Xiong, M. Sugimoto, M. Tomita, S. Paabo, R. Pieszek, C. C. Sherwood, P. R. Hof, J. J. Ely, D. Steinhauser, L. Willmitzer, J. Bangsbo, O. Hansson, J. Call*, P. Giavalisco* and P. Khaitovich*. "Exceptional Evolutionary Divergence of Human Muscle and Brain Metabolomes Parallels Human Cognitive and Physical Uniqueness." PLoS Biol 12, no. 5 (2014): e1001871.

8. Mazin, P., J. Xiong, X. Liu, Z. Yan, X. Zhang, M. Li, L. He, M. Somel, Y. Yuan, Y. P. Phoebe Chen, N. Li, Y. Hu, N. Fu, Z. Ning, R. Zeng, H. Yang, W. Chen, M. Gelfand* and P. Khaitovich*. "Widespread Splicing Changes in Human Brain Development and Aging." Mol Syst Biol 9, (2013): 633.

9. Liu, X., M. Somel, L. Tang, Z. Yan, X. Jiang, S. Guo, Y. Yuan, L. He, A. Oleksiak, Y. Zhang, N. Li, Y. Hu, W. Chen, Z. Qiu*, S. Paabo* and P. Khaitovich*. "Extension of Cortical Synaptic Development Distinguishes Humans from Chimpanzees and Macaques." Genome Res 22, no. 4 (2012): 611-22.

10. Khaitovich, P., I. Hellmann, W. Enard, K. Nowick, M. Leinweber, H. Franz, G. Weiss, M. Lachmann and S. Paabo*. "Parallel Patterns of Evolution in the Genomes and Transcriptomes of Humans and Chimpanzees." Science 309, no. 5742 (2005): 1850-4.