张国捷
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张国捷,男,1982年9月生,博士,研究员。现任哥本哈根大学生物系 终身教授,中国国家基因库副主任,中国科学院昆明动物研究所特聘客座研究员。生物多样性基因组学和生态演化基因组学领域专家。
个人简介    

    2004年毕业于厦门大学生物学系,获理学学士学位;2010年毕业于中国科学院昆明动物研究所遗传学专业,获哲学博士学位;2010年赴丹麦哥本哈根大学交流访问;2011年赴澳大利亚CSIRO交流访问。 2006-2009年任深圳华大基因研究院比较基因组组长,2009-2012年任深圳华大基因研究院副主管,2012-2016年任国家基因库,副主任,2012-2015年,哥本哈根大学助理教授2015-2017年任哥本哈根大学,终身序列助理教授;2017/3-2017/7年任哥本哈根大学,终身序列副教授;2015年至今,任中国科学院昆明动物研究所,客座研究员;2016至今深圳华大基因研究院,副院长;2017/7至今,哥本哈根大学,终身序列正教授。 主持或参与的项目包括中国科学院重大突破项目,中国科学院战略先导专项,国家自然科学基金,国家高技术研究发展计划(863计划),国家重点基础研究发展计划973计划),嘉士伯杰出副教授基金,Lundbeck基金,玛丽.居里基金,哥本哈根大学启动基金等。2010年-至今任万种脊椎动物基因组联盟,项目协调人;2010年-至今 全球基因组标准委员会,委员会成员;2011国际万种脊椎动物基因组联盟,中方协调人;2011 -2014年,鸟纲演化基因组研究计划,发起人和领导者;2012国际昆虫基因组联盟,委员会成员;2012年至今,国际生命复活计划委员会委员会成员2013年至今,Human genomics杂志编委;2013年至今3-biotech杂志,编委;2013年至今,Encyclopedia of Life Sciences,编委;2015年至今国际万种鸟类基因组联盟(B10K)发起人和领导者2016年至今GigaScience杂志,编委;2016年至今全球蚂蚁基因组联盟(GAGA)发起人和领导者;2017年至今,地球生命基因组计划(EBP),发起者和委员会成员。 获2010深圳市高层次专业人才(国家级),2011中国科学院百篇优秀论文,2011云南省优秀科技论文奖(特等奖),2011Sir Frederick McMaster visiting fellow(澳大利亚CSIRO),2012玛丽居里青年学者基金(欧盟);2013李汝琪动物遗传学奖(全国每两年两名获奖者);2014南粤科技优秀学术论文奖2015Lundbeck Fellow(丹麦);2015深圳市青年科技奖2016深圳市孔雀计划海外高层次人才(B);2017嘉士伯杰出副教授奖(丹麦)。 

主要研究方向及内容    

   对于生物体如何响应生理和环境变化并产生适应性表型的分子机制所知甚少。本课题组致力于研究物种形成、生物多样性、生物适应性以及物种发育演化等领域的经典问题,揭示这些过程发生的宏观演化趋势和微观演化的分子学动力。本题组同时从事动物社会性演化方面的研究,研究社会性昆虫的等级分化及行为可塑性的遗传和表观遗传调控机制。现阶段主要有以下研究方向: 

1.生物多样性基因组学研究,主要包括:利用基因组数据重构生命之树;揭开基因组变异、生活史适应性和生态位的相互关系之谜;全球范围内动物-微生物共生模式的研究;基因组演化和动物适应性研究。 

2.发育基因组学研究,主要包括:脊椎动物性别决定的遗传学机制;环境性别决定的表观调控机制;鸟类特异性高度保守元件(avian-specific highly conserved elementsASHCEs)在其他鸟类特异形状发育过程中的潜在调控作用。 

3.社会行为的演化和发育研究,主要包括:蚂蚁的社会性基因组演化机制;蚂蚁行为和形态等级分化的遗传和神经生物学基础;超个体的发育和脑基因组学研究;建立法老蚁为社会性发育与演化研究模式动物 

代表性论文    

Avalos A, Pan H, Li C, Acevedo Gonzalez J P, Rendon G, Fields C J, Brown PJ, Giray T, Robinson GE, Hudson ME,Zhang G*. 2017. A soft selective sweep during rapid evolution of gentle behaviour in an Africanized honeybee.Nature Communications, 8:155 

 

Seki R, Li C, Fang Q, Hayashi S, Egowa S, Hu J, Xu L, Pan H, Kondo M, Sato T, Matsubara H, Kamiyama N, Kitajima K, Saito D, Liu Y, Gilbert MTP, Zhou Q, Xu X, Shiroishi T, Irie N*, Tamura K*,Zhang G*. 2017. Functional roles of Aves class-specific cis-regulatory elements on macroevolution of bird-specific features.Nature Communications8: 14229 

 

Nygaard S, Hu H, Li, C, Schi?tt M, Chen Z, Yang Z, Xie Q, Ma C, Deng Y, Dikow BR, Rabeling C, Nash RD, Wcislo TW, Brady GS, Schultz RT,Zhang G*, Boomsma J*. 2016. Reciprocal genomic evolution in the ant-fungus agricultural symbiosis.Nature Communications7: 12233 

 

Kapheim KM, Pan H, Li C, Salzberg SL, Puiu D, Magoc T, Robertson HM, Hudson ME, Venkat A, Fischman BJ, Hernandez A, Yandell M, Ence D, Holt C, Yocum GD, Kemp WP, Bosch J, Waterhouse RM, Zdobnov EM, Stolle E, Kraus FB, Helbing S, Moritz RF, Glastad KM, Hunt BG, Goodisman MA, Hauser F, Grimmelikhuijzen CJ, Pinheiro DG, Nunes FM, Soares MP, Tanaka ED, Simoes ZL, Hartfelder K, Evans JD, Barribeau SM, Johnson RM, Massey JH, Southey BR, Hasselmann M, Hamacher D, Biewer M, Kent CF, Zayed A, Blatti C, 3rd, Sinha S, Johnston JS, Hanrahan SJ, Kocher SD, Wang J, Robinson GE, &Zhang G*. 2015. Social evolution. Genomic signatures of evolutionary transitions from solitary to group living.Science348(6239):1139-1143. 

 

Jarvis ED*, Mirarab S, Aberer AJ, Li B, Houde P, Li C, Ho SY, Faircloth BC, Nabholz B, Howard JT, Suh A, Weber CC, da Fonseca RR, Li J, Zhang F, Li H, Zhou L, Narula N, Liu L, Ganapathy G, Boussau B, Bayzid MS, Zavidovych V, Subramanian S, Gabaldon T, Capella-Gutierrez S, Huerta-Cepas J, Rekepalli B, Munch K, Schierup M, Lindow B, Warren WC, Ray D, Green RE, Bruford MW, Zhan X, Dixon A, Li S, Li N, Huang Y, Derryberry EP, Bertelsen MF, Sheldon FH, Brumfield RT, Mello CV, Lovell PV, Wirthlin M, Schneider MP, Prosdocimi F, Samaniego JA, Vargas Velazquez AM, Alfaro-Nunez A, Campos PF, Petersen B, Sicheritz-Ponten T, Pas A, Bailey T, Scofield P, Bunce M, Lambert DM, Zhou Q, Perelman P, Driskell AC, Shapiro B, Xiong Z, Zeng Y, Liu S, Li Z, Liu B, Wu K, Xiao J, Yinqi X, Zheng Q, Zhang Y, Yang H, Wang J, Smeds L, Rheindt FE, Braun M, Fjeldsa J, Orlando L, Barker FK, Jonsson KA, Johnson W, Koepfli KP, O'Brien S, Haussler D, Ryder OA, Rahbek C, Willerslev E, Graves GR, Glenn TC, McCormack J, Burt D, Ellegren H, Alstrom P, Edwards SV, Stamatakis A, Mindell DP, Cracraft J, Braun EL, Warnow T, Jun W, Gilbert MT* &Zhang G*. 2014. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds.Science346 (6215): 1320-1331. 

 

Zhou Q*, Zhang J, Bachtrog D, An N, Huang Q, Jarvis ED, Gilbert MT, &Zhang G*. 2014. Complex evolutionary trajectories of sex chromosomes across bird taxa.Science346(6215):1246338. 

 

Zhang G*, Li C, Li Q, Li B, Larkin DM, Lee C, Storz JF, Antunes A, Greenwold MJ, Meredith RW, Odeen A, Cui J, Zhou Q, Xu L, Pan H, Wang Z, Jin L, Zhang P, Hu H, Yang W, Hu J, Xiao J, Yang Z, Liu Y, Xie Q, Yu H, Lian J, Wen P, Zhang F, Li H, Zeng Y, Xiong Z, Liu S, Zhou L, Huang Z, An N, Wang J, Zheng Q, Xiong Y, Wang G, Wang B, Wang J, Fan Y, da Fonseca RR, Alfaro-Nunez A, Schubert M, Orlando L, Mourier T, Howard JT, Ganapathy G, Pfenning A, Whitney O, Rivas MV, Hara E, Smith J, Farre M, Narayan J, Slavov G, Romanov MN, Borges R, Machado JP, Khan I, Springer MS, Gatesy J, Hoffmann FG, Opazo JC, Hastad O, Sawyer RH, Kim H, Kim KW, Kim HJ, Cho S, Li N, Huang Y, Bruford MW, Zhan X, Dixon A, Bertelsen MF, Derryberry E, Warren W, Wilson RK, Li S, Ray DA, Green RE, O'Brien SJ, Griffin D, Johnson WE, Haussler D, Ryder OA, Willerslev E, Graves GR, Alstrom P, Fjeldsa J, Mindell DP, Edwards SV, Braun EL, Rahbek C, Burt DW, Houde P, Zhang Y, Yang H, Wang J, Avian Genome C, Jarvis ED*, Gilbert MT* & Wang J*. 2014. Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation.Science346(6215):1311-1320. 

 

Poulsen M, Hu H, Li C, Chen Z, Xu L, Otani S, Nygaard S, Nobre T, Klaubauf S, Schindler PM, Hauser F, Pan H, Yang Z, Sonnenberg AS, de Beer ZW, Zhang Y, Wingfield MJ, Grimmelikhuijzen CJ, de Vries RP, Korb J, Aanen DK, Wang J, Boomsma JJ, &Zhang G*. 2014. Complementary symbiont contributions to plant decomposition in a fungus-farming termite.Proc Natl Acad Sci U S A111(40):14500-14505. 

Li Q, Wang Z, Lian J, Schiott M, Jin L, Zhang P, Zhang Y, Nygaard S, Peng Z, Zhou Y, Deng Y, Zhang W, Boomsma JJ, &Zhang G*. 2014. Caste-specific RNA editomes in the leaf-cutting antAcromyrmex echinatior.Nature Communications5:4943.  

 

Terrapon N, Li C, Robertson HM, Ji L, Meng X, Booth W, Chen Z, Childers CP, Glastad KM, Gokhale K, Gowin J, Gronenberg W, Hermansen RA, Hu H, Hunt BG, Huylmans AK, Khalil SM, Mitchell RD, Munoz-Torres MC, Mustard JA, Pan H, Reese JT, Scharf ME, Sun F, Vogel H, Xiao J, Yang W, Yang Z, Yang Z, Zhou J, Zhu J, Brent CS, Elsik CG, Goodisman MA, Liberles DA, Roe RM, Vargo EL, Vilcinskas A, Wang J, Bornberg-Bauer E, Korb J,Zhang G*, & Liebig J*. 2014. Molecular traces of alternative social organization in a termite genome.Nature Communications5:3636.  

 

Chen S,Zhang G, Shao C, Huang Q, Liu G, Zhang P, Song W, An N, Chalopin D, Volff JN, Hong Y, Li Q, Sha Z, Zhou H, Xie M, Yu Q, Liu Y, Xiang H, Wang N, Wu K, Yang C, Zhou Q, Liao X, Yang L, Hu Q, Zhang J, Meng L, Jin L, Tian Y, Lian J, Yang J, Miao G, Liu S, Liang Z, Yan F, Li Y, Sun B, Zhang H, Zhang J, Zhu Y, Du M, Zhao Y, Schartl M, Tang Q, & Wang J. 2014. Whole-genome sequence of a flatfish provides insights into ZW sex chromosome evolution and adaptation to a benthic lifestyle.Nature Genetics46(3):253-260.(Co-first author) 

 

Wang Z, Pascual-Anaya J, Zadissa A, Li W, Niimura Y, Huang Z, Li C, White S, Xiong Z, Fang D, Wang B, Ming Y, Chen Y, Zheng Y, Kuraku S, Pignatelli M, Herrero J, Beal K, Nozawa M, Li Q, Wang J, Zhang H, Yu L, Shigenobu S, Wang J, Liu J, Flicek P, Searle S, Wang J, Kuratani S, Yin Y, Aken B,Zhang G*, & Irie N*. 2013. The draft genomes of soft-shell turtle and green sea turtle yield insights into the development and evolution of the turtle-specific body plan.Nature Genetics45(6):701-706. 

 

Fan Y, Huang Z, Cao C, Chen C, Chen Y, Fan D, He J, Hou L, Hu L, Hu X, Jiang X, Lai R, Lang Y, Liang B, Liao S, Mu D, Ma Y, Niu Y, Sun X, Xia J, Xiao J, Xiong Z, Xu L, Yang L, Zhang Y, Zhao W, Zhao X, Zheng Y, Zhou J, Zhu Y,Zhang G*, Wang J*, & Yao Y*. 2013. Genome of the Chinese tree shrew.Nature Communications4:1426. 

 

Zhang G*, Cowled C, Shi Z, Huang Z, Bishop-Lilly KA, Fang X, Wynne JW, Xiong Z, Baker ML, Zhao W, Tachedjian M, Zhu Y, Zhou P, Jiang X, Ng J, Yang L, Wu L, Xiao J, Feng Y, Chen Y, Sun X, Zhang Y, Marsh GA, Crameri G, Broder CC, Frey KG, Wang LF, & Wang J. 2013. Comparative analysis of bat genomes provides insight into the evolution of flight and immunity.Science339(6118):456-460.  

 

Qiu Q,Zhang G, Ma T, Qian W, Wang J, Ye Z, Cao C, Hu Q, Kim J, Larkin DM, Auvil L, Capitanu B, Ma J, Lewin HA, Qian X, Lang Y, Zhou R, Wang L, Wang K, Xia J, Liao S, Pan S, Lu X, Hou H, Wang Y, Zang X, Yin Y, Ma H, Zhang J, Wang Z, Zhang Y, Zhang D, Yonezawa T, Hasegawa M, Zhong Y, Liu W, Zhang Y, Huang Z, Zhang S, Long R, Yang H, Wang J, Lenstra JA, Cooper DN, Wu Y, Wang J, Shi P, Wang J, & Liu J. 2012. The yak genome and adaptation to life at high altitude.Nature Genetics44(8):946-949.(Co-first author) 

 

 

 

 

 

    

    

    

    

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